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Small RNA测序
在经qPCR质量检测合格后进行Solexa高通量测序。
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最后更新:2013-7-29半年访问:61
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技术路线

 

1.从总RNA中纯化分析小RNA; 


2.连接RNA接头并纯化


3.合成第一链及第二链cDNA; 


4.PCR扩增测序文库; 


5.在经qPCR质量检测合格后进行Solexa高通量测序。 

 

 信息分析内容


1、 快速获得您感兴趣的细胞、组织或生物体内的miRNA种类及其丰度,并发现新的miRNA,以及不同细胞或者不同组织内的miRNA的差异表达信息。

 

2、 研究某种基因如何通过miRNA途径影响该基因的表达调控和发挥其生物学功能。

 

3、 研究miRNA在癌症或者其他疾病中的作用机制,并对该疾病的诊断和治疗提供重要解决策略。

 

4、 研究miRNA在某病毒侵染和抗病毒中的作用,为有效抵抗该病毒侵染提供重要解决策略。

 

5、 研究miRNA在植物的正常生长,抗旱、抗逆等过程中均起着重要的生物学功能。

 

送样要求


样品浓度:总RNA样品浓度不低于750ng/ul,总量不低于20ug,提取总RNA时请避免使用过柱法;Small RNA 样品浓度不低于2ng/ul,且Small RNA:Total RNA≥0.3%。

 

样品纯度:总RNA样品OD值在1.8-2.2之间,制备样品时请不要使用LiCl沉淀。建议在条件允许情况下,提供可供两次样品制备的量,以保证测序的按时进行。

 

需提供每个样品具体的浓度、体积、溶剂成分、制备时间以及物种来源,同时附上QC数据,可包括电泳胶图、分光光度或者Nanodrop仪器检测数据、Agilent Bioanalyzer仪器检测数据等(我们要求至少要有其中一种的检测结果),确保总RNA 28S:18S至少大于1.8。

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