基于SLAF-seq技术的多态性图谱

应用目标：获得大量有序列的分子标记，直接构建物种的分子标记指纹数据库，建立物种分子鉴定平台。为后续研究打下基础。

目前没有基因组参考序列，无法通过重测序等手段高效定义多态性的物种。如小麦、棉花、油菜、辣椒、鱼类、对虾、花卉、林木、大麦、药用植物等。

已有或即将有全基因组参考序列，利用重测序寻找多态性对成本要求过高的物种。如玉米、大豆、水稻、甘蓝、白菜、高粱、黄瓜、西瓜、马铃薯、烟草、番茄、拟南芥等物种。

拥有2个以上具有表型差异的个体材料，个体间差异越大越有利于找出更多的多态性分子标记。该技术尤其适用于骨干亲本的遗传差异鉴定。

针对构建临时（如F2分离群体）或永久群体（如重组自交系、近等基因系、双单倍体系、回交近交系等）的父、母本材料进行多态性分析，可以利用找出的多态性标记到群体里进行与目标性状的关联性分析。

项目开发方案

整体计划3个月完成分子标记开发及多态性图谱绘制，具体时间规划如下表所示。根据物种的不同开发时间会稍有不同。

基于SLAF-seq技术的多态性图谱绘制开发时间

技术路线 基于SLAF-seq技术的多态性图谱绘制技术路线示意图

百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技术企业，公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术，拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块；拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队；公司自成立以来，注重创新发展，科研成果成果层出不穷，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇，累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项，软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台，满足科研工作者多种科研需求，努力打造基因产业国际一流企业，“为世界创造新的可能！”