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真菌基因组测序
基因组序列拼接,基因注释,基因功能分类,比较基因组及进化分析
服务类别:测序/合成总访问:1152
最后更新:2013-8-27半年访问:67
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真菌属于较低等的真核生物,种类繁多,在自然界中分布广泛。据统计,全世界约有150万种真菌,其中包含许多具有重要的药用价值和食用价值的有益真菌,同时也存在着大量能够引发动植物病害的致病菌。因此,合理利用有益真菌,控制和预防有害真菌对人类的生产和生活具有重要的意义。真菌基因组的阐明,将为真菌特性的分析提供有用的依据。随着新一代高通量测序技术的成熟,基因组测序成本已大大降低,使得快速而经济的进行真菌基因组测序成为可能,目前真菌基因组学研究已经进入了一个快速增长的时期。 
百迈客优势
拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台,可以根据合作老师的具体要求灵活安排实验,周期短,质量可靠; 技术人员经验丰富,可在第一时间内为合作老师提供完善的实验方案,解决实验问题,分析实验结果; 拥有专业的生物信息分析团队和大型计算机设备,能够提供个性化的生物信息分析服务。 真菌基因组精细图采用构建不同大小DNA插入片段的测序文库,进行Illumina短片段测序和末端配对测序(Mate-Pair,MP)。当测序数据量达到基因组大小的100×以上时,即可保证基因组组装结果达到精细图的标准。

基因组序列拼接
原始数据统计、基因组覆盖度计算、组装结果统计等。

基因注释
编码基因预测,基因功能注释(NT、NR、Swiss-Prot、Interpro等)、Non-coding RNA注释、重复序列注释等。

基因功能分类
GO富集分析、KEGG通路分析等。
 

比较基因组及进化分析
与近缘物种的基因组序列比对,进行SNP、SV等变异结构检测、pan-genome和core-genome组成分析、同源基因分析、进化分析等。

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