宏基因组测序

• 宏基因组测序是对特定生境样品中微生物群体基因组进行序列测定，进而分析微生物群体基因组成及功能，解读微生物群体多样性与丰度，探求微生物与环境，微生物与宿主之间的关系，发掘和研究新的、具有特定功能的基因。
   
• 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，可以根据合作老师的具体要求灵活安排实验，周期短，质量可靠；
• 技术人员经验丰富，可在第一时间内为合作老师提供完善的实验方案，解决实验问题，分析实验结果；
• 拥有专业的生物信息分析团队和大型计算机设备，能够提供个性化的生物信息分析服务。
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物种鉴定 将所得的16S/18S rDNA序列与Silva、RDP等数据库进行比对，得出样品中所含物种的信息； 多样性统计学分析 将所得的16S/18S rDNA序列进行聚类，得到相应的OTUs（分类操作单元）。通过统计学手段，分析出环境样品中的主要成分及不同样品间的明显差异因素。结合物种鉴定，可以得到关键菌群； 宏基因组拼接 对环境样品DNA进行大规模测序后，通过严格的拼接方式，可获得较长的DNA片段。当样品的生物多样性较低，且达到一定测序通量后，很有可能直接获得一个或多个微生物基因组草图；   功能分析 将所得序列与已有的数据库进行比对，并进行基因功能的注释。其中，常用的数据库包括NT、NR、GO、COG、KEGG、SEED、Swiss-Prot等；   微生物群落结构及功能 通过大量测序，可以获得样品的群落结构信息，如微生物物种在该环境下的分布情况及成员间协作关系等。通过实验还可以确定一些特殊的主要基因或DNA片段。对于多个样品，还可做相应的比较分析，发掘样品间的相同点与不同点。

• 样品要求：管上请注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。同时需详细填写样品信息单，提供nanodrop, Gel-Electrophotometric,或者Aglient中一种或多种形式的样品分析结果；
• 样品纯度：260/280值应在1.8～2.0 之间；OD260/230在2.0左右；
• 样品浓度：样品的浓度越高越好，最低不应低于100ng/ul；
• 样品的量：样品制备需要大于25 ug 基因组DNA样品；
• 电泳检测：主带清晰，无降解或有部分降解，无RNA和蛋白污染；
• 我们收到样品后，需要对样品进行检测，最终样品的量和纯度，以我们的检测结果为准；
• 在运输过程中，最好放在干冰中，时间不要超过72小时，如果利用冰袋运输，则时间最好不要超过24小时；且在运输过程中请用parafilm将管口密封好，以防出现污染；
• 请客户仔细纯化样品，尽量避免污染进入，并请客户将所送样品保留备份。
• 项目完成，数据提交给客户后，我们将不再保存样品，如有样品剩余，客户需要样品，请在项目进行前以书面或邮件的形式正式说明，并在项目结束后一周内将样品拿走，逾期我们将不予保留。

• 样品请置于1.5 ml管中，管上注明样品名称、浓度以及制备时间，管口使用Parafilm封口。在运输前将所有样品管固定于50 ml带盖离心管（或其他固体支撑物）中，再将50 ml管放在封口袋中。
• 使用足量的干冰运输（建议尽量选用较大块的干冰，大块的干冰挥发较慢），并且尽量选用较快的邮递方式，以降低运输过程中样品降解的可能性。
• 如果条件许可，可在邮寄的箱子上下添加部分棉花，以保证尽量隔绝热量的传递。
• 为了您的实验顺利进行，请您务必填写样品信息单。

百迈客生物(BioMarker)成立于2009年5月，是一家高新技术企业，公司基于功能基因组学的BT+IT(高通量基因测序技术、生物信息技术、高性能生物云计算技术)技术，拓展出了高通量测序、生物云平台、质谱检测、智能制造四大业务板块；拥有以博士和硕士为主体的研发、生产团队；公司自成立以来，注重创新发展，科研成果成果层出不穷，先后在《Nature》、《Cell》、《Nature Genetics》、《Advanced Science》、《Nature Communications》等国际著名期刊上发表高质量合作文章近千篇，累计影响因子超过4500分。拥有国家发明专利技术60余项，软件著作权近200项。公司拥有Illumina、PacBio、Nanopore、BioNano、AB SCIEIX QTRAP, Waters Q-TOF等全面的测序平台，满足科研工作者多种科研需求，努力打造基因产业国际一流企业，“为世界创造新的可能！”