sgRNA设计CRO服务

gRNA的设计

gRNA设计的在线工具很多，常用的如张锋实验的CRISPOR（http://crispor.tefor.net/），只需输入目标序列，种属基因组与相应的PAM，则可以得出多个gRNA，以及每个gRNA对应的特异性、切割效率和潜在脱靶位点，一般选择特异性、切割效率得分高的gRNA。

但是很多实验需要根据经验设计sgRNA。如果需要手动设计gRNA，则需要考虑其特异性与切割效率。在靶点设计时要综合考虑所有候选靶点的序列、位置、正负链、GC含量、潜在的脱靶位点等信息。

sgRNA设计的一般流程

1. 分析靶基因信息

2. 选择靶标区域设计sgRNA

3. 脱靶分析

艾迪优势：

1. 10年基因编辑研发经验，3年CRO服务

2. 自主知识产权sgRNA设计逻辑，数千例成功基因编辑sgRNA案例

3. 基因编辑治疗的实践经验

附：sgRNA设计，你需要注意那些问题？

靶基因信息的分析。在NCBI、Ensembl等查询过程中要注意物种的选择和确定靶基因在数据库中的登录号，避免查找错误，再进一步关注其所在基因座上下游基因情况、转录本数量、外显子数量及长度、翻译起始位点与终止位点等信息。

靶区域的选择原则

对于基因敲除可采用移码突变和片段敲除，一般采用移码突变，2种不同策略需遵循以下原则：不影响其他基因，尤其是编码蛋白的基因；所敲除的外显子编码序列之和为非3的倍数；尽可能影响所有的转录本；不会残留蛋白的功能结构域。