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翻译组学主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖体,新生肽链等物质的种类与丰度,动态与动力学性质,以及它们所担负的生物学功能。
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翻译组学主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖体,新生肽链等物质的种类与丰度,动态与动力学性质,以及它们所担负的生物学功能。编码在DNA上的信息要经过转录和翻译,最终生成蛋白质,才能执行生物学功能。翻译控制在生物抗逆、病毒侵袭、肿瘤发生与发展等宏观过程都有着紧密的联系。此外,翻译组学的研究对生化工程、合成生物学等应用科学也具有直接的指导意义。翻译组学被国际人类蛋白质组计划(HPP)列为四大支柱之一。
研究方法
mRNA经过转录加工为成熟的mRNA后,还需要翻译为蛋白才能发挥其功能。翻译过程中会形成核糖体-新生肽链复合物(RNC,Ribosome Nascent-chain Complex),复合物中的mRNA即为能翻译成蛋白的mRNA。翻译组测序用超速离心的方法分离出RNC并进一步分离其中的mRNA进行测序,可得到正在翻译的mRNA信息。
生物信息分析内容
1、数据质控
2、基因表达水平分析
3、差异基因筛选
4、GO/KEGG富集分析
5、蛋白互作网络分析
6、与转录组测序或蛋白质组数据联合分析
7、可视化结果展示
应用方向
1、发现和鉴定新蛋白
2、蛋白质差异表达分析
3、非编码RNA(miRNA、LncRNA、cirRNA)作用机制研究
技术参数
样本类型:组织或细胞。承启生物可提供RNC分离及mRNA提取。客户采集样本,需采用公司提供RNC-mRNA测序专用样本保存液。
测序策略:HiSeq PE150,推荐数据量:3G clean data
项目周期:35个工作日
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