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翻译组测序服务

翻译组测序服务


TRAPSeq (Targeted Purification of Polysomal mRNA Sequencing)
翻译组学主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖体,新生肽链等物质的种类与丰度,动态与动力学性质,以及它们所担负的生物学功能。
服务类别:测序/合成总访问:2344
最后更新:2017-3-13半年访问:72
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  • 服务介绍
  • 公司简介

翻译组学主要研究mRNA,tRNA,microRNA,核糖体,新生肽链等物质的种类与丰度,动态与动力学性质,以及它们所担负的生物学功能。编码在DNA上的信息要经过转录和翻译,最终生成蛋白质,才能执行生物学功能。翻译控制在生物抗逆、病毒侵袭、肿瘤发生与发展等宏观过程都有着紧密的联系。此外,翻译组学的研究对生化工程、合成生物学等应用科学也具有直接的指导意义。翻译组学被国际人类蛋白质组计划(HPP)列为四大支柱之一。

 

研究方法

mRNA经过转录加工为成熟的mRNA后,还需要翻译为蛋白才能发挥其功能。翻译过程中会形成核糖体-新生肽链复合物(RNC,Ribosome Nascent-chain Complex),复合物中的mRNA即为能翻译成蛋白的mRNA。翻译组测序用超速离心的方法分离出RNC并进一步分离其中的mRNA进行测序,可得到正在翻译的mRNA信息。

 

生物信息分析内容

1、数据质控

2、基因表达水平分析

3、差异基因筛选

4、GO/KEGG富集分析

5、蛋白互作网络分析

6、与转录组测序或蛋白质组数据联合分析

7、可视化结果展示

 

应用方向

1、发现和鉴定新蛋白

2、蛋白质差异表达分析

3、非编码RNA(miRNA、LncRNA、cirRNA)作用机制研究

 

技术参数

样本类型:组织或细胞。承启生物可提供RNC分离及mRNA提取。客户采集样本,需采用公司提供RNC-mRNA测序专用样本保存液。

测序策略:HiSeq PE150,推荐数据量:3G clean data

项目周期:35个工作日

 

深圳承启生物科技有限公司

电话:0755-26413091

QQ业务咨询:2796053217

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邮箱:service@chi-biotech.com

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