长链非编码RNA (lncRNA)测序服务

lncRNA 测序（long non-coding RNA）是指长度超过200nt的长链非编码RNA，是非编码RNAs(non-coding RNAs，ncRNAs)的重要组成部分。参与了基因组印记、转录激活、转录抑制等多种重要的调控过程，lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点。

 

生物信息分析内容

1、数据产出统计和质量评估

2、与参考基因组比对 

3、基因表达水平分析

4、RNA-seq整体质量评估

5、lncRNA 编码潜能分析、保守性分析、exon个数统计

6、差异基因筛选及聚类分析

7、差异mRNA或lnc RNA的靶基因GO、KEGG Pathway富集分析

8、差异mRNA或lnc RNA的靶基因蛋白互作网络分析

9、新转录本预测

10、反义转录本预测(链特异性测序)

11、差异非编码RNA靶基因预测

12、转录因子注释（仅对人和小鼠）

13、SNP/Indel分析

14、可变剪切分析

15、lncRNA-mRNA 共表达网络构建

 

技术参数

样本类型：total RNA

样本要求：总量≥4 μg，浓度≥120 ng/μL

文库类型：链特异性文库

测序策略：HiSeq PE150，推荐数据量：≥10 G clean data

项目周期：45个工作日

 

结果示例

 

三种主要类型lncRNA数目统计

 

差异表达基因火山图

 

共表达聚类树

 

特定关注lncRNA与coding基因共表达模块相关性矩阵热图

 

深圳承启生物科技有限公司

电话：0755-26413091

QQ业务咨询：2796053217

网址：http://www.chi-biotech.com

邮箱：service@chi-biotech.com

地址：深圳市南山区泰邦科技大厦15C

承启生物是一家汇集世界顶尖科研成果、立足珠三角地区、辐射全球的高科技生物公司。公司拥有完全自主研发、已被学界公认的超高精度基因测序分析算法，致力于用领先业界的基因研究技术造福科研及医疗。

本公司的核心技术团队由在分子生物学、大规模测序、生物信息学、临床医学等领域的做出突出贡献的专家组成，他们在国内外具有相当的知名度和学术影响力。该团队在国际上首次建立了一系列基于大规模测序的高精度实验与应用技术，可以为科研和医疗领域的单位客户或个人客户提供方便快捷、准确详尽、高度定制化的大规模精确测序与信息分析服务。