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原核转录组测序

原核转录组测序


The original nuclear transcriptome sequencing
原核转录组针对原核微生物,用新一代高通量测序技术对该物种的特定组织或细胞进行转录组测序,与参考基因组比较,可以得到基因表达差异、GO功能分类、以及代谢通路分析等信息。
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最后更新:2015-8-4半年访问:54
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原核转录组测序
原核转录组针对原核微生物,用新一代高通量测序技术对该物种的特定组织或细胞进行转录组测序,与参考基因组比较,可以得到基因表达差异、GO功能分类、以及代谢通路分析等信息。原核转录组测序通过对原核total RNA样本去rRNA后进行文库制备,采用Illumina公司高通量测序平台测序,通过信息分析,可以获得基因表达差异信息、SNP分析、预测新转录本等信息,这为研究基因的结构和基因的表达调控提供了一个重要的手段。

原核链特异性全谱转录组测序通过对原核total RNA样本去rRNA后进行文库制备,采用Illumina公司高通量测序平台测序,通过信息分析,可以确定一条转录本是来自正义链还是反义链并且可以确定转录本的边界,能比普通转录组更精确地统计转录本的数量,还可同时可以挖掘non-coding RNA的信息,这为研究基因结构和基因表达调控提供了技术支持。菲沙基因可以为您提供普通原核转录组测序、特异性全谱转录组测序以及sRNA分析。

 

项目流程(参照如下)

 

信息分析(参照如下)


交付结果
数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析
报告:详细的统计图表和方法描述

 

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