中翰金诺拥有973科学家率领的、经验丰富的生物信息学分析团队,在新一代测序结果分析、生物芯片数据挖掘、非编码RNA等领域有丰富的实践经验。能为广大的生物和医疗工作者提供最好的数据分析服务,为您的科学研究提供便利。
A、癌症样品测序数据分析
具体内容如下:测序数据与参考序列的比对,统计唯一比对率、高质量比对率、测序深度和覆盖度;各种变异检测和注释,如结构变异、SNP、SNV、插入和缺失、拷贝数变异、基因重排等。寻找癌症相关基因;癌症相关基因功能富集;癌症相关基因通路分析等;
B、外显子测序数据分析
具体内容如下:基本数据处理;结构变异识别与计算;短插入/缺失探测;疾病变异注释和GO功能注释;变异体功能属性分析;蛋白质突变结构建模;融合基因识别;突变体生存分析;低频非同义可编码区变异的识别;连锁分析生物;通路分析
C、转录组测序数据分析
具体内容如下:数据统计;已知参考基因组,比对基因表达分析;未知参考基因组,拼接基因组;样品间基因表达差异分析;可变剪切形式分析;差异基因聚类分析、GO功能显著性分析;差异基因代谢通路富集分析;差异基因上游motif分析;融合基因的鉴定;蛋白相互作用网络;人类非编码RNA的鉴定、表达水平分析等
D、 DNA甲基化测序数据分析
具体内容如下:测序序列与参考基因组比对分析;DNA甲基化信号在基因组上的分布;GC含量统计;计算基因元件的甲基化富集倍数;基因组重复序列的GC含量和CpG含量联合分析;启动子区域的DNA甲基化分析;差异甲基化相关基因的GO分析、KEGG分析等;
E、ChIP-Seq数据分析
具体内容如下:测序结果与参考基因组比对;Peak calling:统计样品Peak信息;每个样品Peak关联基因及GO注释;多个样品Peak关联基因的差异分析;Peak附近区域序列提取及motif分析;转录因子结合位点识别;转录因子结合识别与表达谱数据关联分析;构建信号图谱等
F、miRNA测序分析
具体内容如下:miRNA注释;样本miRNA表达差异分析、聚类分析;miRNA靶基因预测、KEGG分析、GO分析;miRNA进化分析;群体遗传学分析;miRNA调控网络分析等
G、其他生物信息分析服务
基因组注释与分析;比较基因组与分子进化分析;转录组芯片数据分析;宏基因组测序分析;蛋白质组学与药物代谢动力学、药物分析等。
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中翰金诺生物信息技术有限公司(中翰盛泰临床技术研究院)是中翰盛泰生物技术有限公司旗下的子公司,于2012年正式成立。中翰盛泰生物技术有限公司是一家专业从事临床检验设备、体外诊断试剂及POCT产品的研发、生产和销售的投资型企业。经过十年的不断努力与发展,目前拥有国内规模最大的POCT产品生产基地,年销售额达到3亿元。
中翰金诺位于杭州钱江高新技术开发区内,拥有2100m2的研发技术平台,以提供临床解决方案的个体化诊断平台产品整合思路,逐步将个体化医疗的概念具体应用到临床检验、个体化医疗、社区医疗等领域,并致力于该领域的市场拓展,引领移动数码、即时检验新潮流。中翰金诺其核心成员由美国斯坦福大学、UIC大学、加州大学以及国内复旦大学、上海交通大学、同济大学的生物信息学、生物学、医学等高学历人才组成。公司技术顾问团队成员均是生物医学、生物信息学界的专家,科研、临床经验丰富,在cell、nature、science等国际顶尖刊物上发表过多篇论文,SCI总分值超过200分。
中翰金诺在医学的基础研究领域拥有一批经验丰富的技术人员,主要聚焦在肿瘤侵袭转移(EMT)、miRNA,lncRNA等热点研究方向。研究成果稳步增长,已拥有miRNA载体文库、miRNA靶基因验证体系、高通量测序整体解决方案,肿瘤药物筛选平台。可以为客户提供个性化、整体化的实验路线设计、生物信息学分析、实验外包及SCI论文润色等服务。