HiFi-C

HiFi-C实验步骤：

1.交联固定：甲醛交联，使空间邻近的DNA片段通过结合蛋白交联形成复合物；
2.酶切连接：用限制性内切酶消化染色质，连接形成互作产物，解交联后纯化DNA;
3.建库测序：构建SMRT Bell DNA文库，通过PacBio Revio测序平台高通量测序

HiFi-C组装策略：

1.T2T基因组2.0版：有助于解决着丝粒区域，rDNA区域的正确组装；
2.大基因组：有助于大基因组重复序列挂载；
3.二倍体分型基因组：有助于同源染色体准确分型；
4.多倍体基因组：有助于同源染色体准确分型。

 HiFi-C应用优势：

1.数据深度要求少（20-30X），分析周期快；
2.能验证组装结果，辅助同源多倍体分型；
3.在高重复区域（例如SD重复）、着丝粒区域有更强的互作信号，更有利于T2T组装；
  
 HiFi-C互作优势：

1.HiFi-C可同时检测多位点互作，助力chromatin hub研究；
2.HiFi-C可准确获取基因组上重复区域互作，为揭示等位特异性调控机制提供新思路；
3.HiFi-C可以全面捕获强度较弱的互作。
 

菲沙基因提供多种三维基因组和表观遗传技术服务，涵盖Hi-C、Micro-C、HiChIP、Capture Hi-C 、4C-seq、ATAC-seq、ChIP-seq、CUT&Tag（组蛋白修饰、转录因子、R-loop结构）、HiCuT、WGBS、Tn5-FISH、Hi-R等。同时紧跟科研前沿，推出表观图谱、泛三维基因组等全方位解决方案。

至今，菲沙基因已完成包括动物、植物和微生物在内的数百个物种数千个项目的三维基因组学和表观遗传学实验及数据分析服务。其中，利用创新的三维基因组学技术和表观遗传学技术助力动物、植物和微生物研究成果见刊于《Nature》、《Science》、《Cell》、《Bone Research》、《Nature Cancer》、《Nature communications》等国际顶级期刊，应用领域涉及到疾病分子机制、生物种质资源的育种研究、微生物的基因组结构和功能研究等。菲沙基因期待与您的深度合作！

  

武汉菲沙基因信息有限公司位于武汉国家生物产业基地——光谷生物城，是一家集三维基因组学技术服务、第二代和第三代基因测序、生物信息软件开发、生物信息分析、基因组数据库搭建、分子标记开发、基因检测技术研发等生物信息上下游产业于一体的高新技术企业。菲沙基因联合国内外著名高校和科研机构，拥有一批国际知名的基因组学和生物信息学专家，致力于提供全球领先的生物信息技术服务。
依托国际先进的第二代和第三代高通量测序平台，以及20万亿次的高性能计算平台，菲沙基因可以针对人类健康、疾病防治、环境保护、动植物研究、微生物应用等不同领域的基因组学问题展开研究，能够为不同需求的合作伙伴提供包括实验设计、样品选取、测序策略，以及后续定制化信息分析在内的一站式、个性化整体解决方案。
随着科学技术的发展，即将到来的基因组学第三次浪潮——三维基因组研究，已经成为全球生物学界的科研焦点。菲沙基因在提供3C、4C、5C、Hi-C等三维基因组构象技术服务的基础上，在国内率先引进最新的染色质远程交互测序技术（ChIA-PET），为进一步研究基因组三维空间结构与功能提供了完整解决方案，能够协助合作伙伴在下一轮基因组研究浪潮中抢占学科发展的有利先机。
凭借全球领先的生物信息分析能力，菲沙基因已经以多种形式先后与国内外著名高校和科研机构展开了深度合作，合作伙伴包括杰克森实验室、西蒙菲沙大学、中国科学院、中国农科院、清华大学、上海交通大学、复旦大学、华中农业大学、第二军医大学、同济医院、上海东方肝胆外科医院等。
“以生物信息学助推生命科学的研究，以基因组医学促进人类健康的发展”是菲沙基因的使命；“成为生物信息学领域的引领者”是菲沙基因的愿景。我们期望与各领域的专家合作，制定最优的解决方案，提供快速、准确、专业的服务，共同迎接生命科学研究中的挑战。