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原始数据整理、过滤及质量评估，基因组序列拼装与分析
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微生物基因组重测序
简介：全基因组重测序是对基因组序列已知物种的个体进行基因组测序，并在个体或群体水平进行差异性分析的方法。. 重测序能够检测全基因组的罕见变异，可以获得大量的单核苷酸多态性（SNP）信息、序列的插入缺失位点信息，还可以检测到多种结构变异（SV）和拷贝数变化（CNV）。
一、技术路线
推荐平台：Illumina MiSeq、Illumina HiSeq 2000。
二、信息分析
1.原始数据整理、过滤及质量评估
2.基因组序列拼装与分析：
与参考基因组比对（共线性） 基因组岛鉴定 SNPs和InDel的检测及在基因组的分布 CNV和SV的检测及在基因组的分布 包含变异基因的COG和GO富集分析 包含变异基因的代谢途径分析（KEGG pathway）3.根据客户需求进行个性化分析
三、送样要求
1、 细菌：浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg ，OD260/280值介于1.8-2.0之间的细菌基因组DNA，并确保DNA无降解，无污染。
2、 真菌：样品浓度≥200 ng/μl，总量≥50 μg ，OD260/280值介于1.8-2.0之间的DNA，样品浓度越高越好。
3、 样品保存期间切忌反复冻融。
4、 送样管务必标清样品编号，管口使用Parafilm 膜密封。
5、 提供DNA电泳检测照片，用自封袋密封后随样品一起送样。
四、派森诺优势
HiSeq 2000测序通量可达600G，适合全基因组测序。80×以上的测序深度，可以保证数据的准确以及SNP的发现。MiSeq的速度更快，但相对来说成本会较高。
派森诺生物拥有多个高端测序平台，根据合作伙伴的实际需求，提供高性价比的微生物基因组重测序。
手机版：微生物基因组重测序
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