人类vs🐭免疫多肽，跨物种真相大公开

在哺乳动物体内，适应性免疫（adaptive immunity）是一个进化过程中保守的生化过程。其中，某些蛋白质中的多肽片段通过抗原处理及呈递系统（antigen processing and presentation system, APP）被表达在细胞表面，而从被CD8+ T细胞识别，这些多肽被称为MHC 免疫多肽（MHC immunopeptidome）。 由于MHC免疫多肽存在极大的个体差异，因此免疫多肽研究的第一步就是系统性的表征大批量样品中的免疫多肽，质谱法由于无偏性及灵敏度，已经被很多研究项目采用，用于针对不同的物种的研究。目前这些研究大都专注于特定的物种，没有从跨物种层面考虑。因此，来自加拿大和德国的课题组，通过整合多组学数据分析，比较了

人类和🐭小鼠的MHC多肽，通过比较其免疫多肽的相同与不同，为我们揭示了MHC免疫多肽相关的几个常见问题。 在论文“nderstanding the constitutive presentation of MHC class I immunopeptidomes in primary tissues”中，科学家们通过整合蛋白质组学，转录组学数据（图1），对于人类和小鼠的免疫多肽（来源于不同器官）进行了系统的分析，并提出了7个对MHC免疫多肽常见的问题。

Q1. 免疫多肽的不同分型在人体不同组织的表达概率相同吗？ 目前对已免疫多肽的一个共识是人类MHC-I免疫多肽存在着异质性，随之而来的问题就是在异质性的前提下，各个分型在不同组织内的表达概率是否一致？在该研究中，研究人员首先对来源于29个人类

个体的数据进行分析，发现人类MHC-I多肽的3种分型（HLA- A/B/C）在不同组织内的分布存在极大的差异（图3A），进一步细化到各亚型的不同分型更加证实了这种差异。例如, 个体AUT-DN12的结肠中，HLA-A*02:01的比例明显高于其他个体（图3 B-D)。 为了进一步研究这种“组织特异性”的差异在人类群体水平上是否同样存在，作者进一步计算了群体水平上不同分型的平均富集值。通过热点图（图4）可以发现，在群体水平上，某些分型在特定组织内的表达明显升高（图4）