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TSQ Quantiva 出色灵敏度提升复杂基质中目标肽段定量能力

浏览次数:2914 发布日期:2017-2-9  来源:本站 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负
李静
赛默飞世尔科技(中国)有限公司
 
关键词
TSQ Quantiva;肽段定量;灵敏度
 
前言
生物标志物的研究包括发现(Discovery),验证(Verification),确认(Validation) 阶段, 最后进入临床检验(Clinical Utilization)等更深入的阶段。在研究生物标志物的过程中,主要的挑战在于如何在成分复杂的生物样品中发现中等丰度或低丰度的蛋白质,这就对仪器性能提出了很高的要求,即仪器必须具备高灵敏度,以保证低丰度蛋白质的检出。
 
TSQ Quantiva 是赛默飞世尔科技在2013 年ASMS 上推出的全新一代三重四极杆质谱仪。TSQ Quantiva 采用主动离子管控技术(Active Ion Management,AIM)(图1)技术优化离子生成及从离子源至检测器的传输,使这款仪器能够以最优异的灵敏度定量分析最复杂和最具挑战性的样品。本实验旨在考查TSQ Quantiva 在复杂基质中针对目标肽段定量的灵敏度。
 
 
图1. 主动离子管控技术(AIM)示意图
 
实验条件
材料与方法
PIERCE Peptide Retention Time Calibration Mixture(货号: 88320),内含15 条不同疏水系数(Hydrophobicity Factor, HF)的重标肽段。采用5ng/μL E.coli 酶解产物进行逐级稀释,获得浓度为0.0005 fmol/ μL, 0.0025 fmol/ μL, 0.005 fmol/ μL, 0.05 fmol/μL, 0.5 fmol/ μL, 5 fmol/ μL, 50 fmol/ μL 的样品。实验中通过Pinpoint 1.3 软件进行离子对的选择(图2),每个母离子选择4 个子离子,其中1 个子离子作为定量离子,3 个子离子作为定性离子。最终建立了15 条目标肽段,共计60个离子对的SRM 方法,其中加粗部分为定量离子(表1)。
 
图2. Pinpoint 1.3 软件进行离子对的选择
 
表1. 15 条肽段信息
 
 
高效液相色谱分离
高效液相色谱仪: Thermo Scientific EASY-nLC 1000
预柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(2cm, ID75μm, 3μm)
分析柱:Dionex PepMap C18 色谱柱(15cm, ID75μm, 3μm)
流动相:A,含0.1% 甲酸的水溶液;B,含0.1% 甲酸的乙腈溶液
梯度: 2%-5% B 2 min,2%-45% B 42min,45%-90% B 3 min,90%B 3min
流速:300 nL/min
上样量: 2 μL
 
质谱分析
质谱仪:Thermo Scientific TSQ Quantiva
离子源:NanoFlex 离子源
离子模式:正离子
喷雾电压:2.0 KV
毛细管温度:275 ℃
Q1 and Q3 resolution: 0.7 Da;
Cycle time:2s
碰撞能量:通过公式CE=0.034 × 母离子的m/z + 5.314 计算得到相应肽段的碰撞能量,并在此基础上CE加减2 进行进一步优化,选择最优碰撞能量。
 
实验结果
本实验采用全新一代三重四极杆质谱TSQ Quantiva 对复杂基质中15 条重标肽段进行定量分析,均可获得良好的色谱峰形和质谱响应(图3)。以肽段SSAAPPPPPR* 为例,检出限为(LOD)1amol,定量下限(LLOQ)为5amol(图4)。如图5 标准曲线所示,在5amol-100fmol 五个数量级浓度范围内,浓度与峰面积的线性相关系数在0.99 以上,同时,在amol 级水平仍可获得良好重复性(图6)。15 条肽段的标准曲线和线性范围参见表2。
 
 
图3. 15 条肽段总离子流图(TIC)(上样量100fmol)
 
 
图4. 肽段SSAAPPPPPR* 不同上样量提取离子流图(EIC)m/z493.8-> m/z 335.7
 
 
图5. 肽段SSAAPPPPPR* 标准曲线
 
 
图6. 肽段SSAAPPPPPR* 在amol 水平重复性
 
表2. 15 条肽段标曲和线性范围
 
 
结论
实验表明,得益于主动离子管控技术(AIM),TSQ Quantiva在复杂基质中针对目标肽段的定量灵敏度表现突出,极大地提升了TSQ 质谱平台定量复杂基质中目标肽段的能力,适用于复杂生物学样本中低丰度蛋白质的分析,可用于潜在生物标志物的确证工作。
发布者:赛默飞世尔科技(色谱与质谱)
联系电话:13386161207
E-mail:ping.shen2@thermofisher.com

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