LCM+4D蛋白质谱： 深度空间蛋白质组

       蛋白质作为功能分子，在生命活动中起到非常关键的作用。蛋白质组学研究的目的是对整个组织或细胞蛋白质组进行全面的研究。然而，无论是大块组织的蛋白质组检测，亦或是质谱流式等技术，都只获得了组织或细胞中的蛋白质表达水平，而缺失了蛋白质在组织中的空间表达分布信息。为此，空间蛋白质组检测技术应运而生。这类技术可以确认蛋白质在空间上特定区域的表达水平，从而更精准地比较不同组织区域的蛋白表达差异和功能差异，使研究组织空间区域内蛋白表达成为可能。
       SBC提供了深度空间蛋白质组技术，可进行高灵敏度的空间非靶向蛋白质组检测。该技术使用激光捕获显微切割技术（LCM）将组织切片（冷冻切片、FFPE）中的目标区域进行切割捕获，然后提取蛋白质，用4D质谱技术（timsTOF Pro）进行蛋白质组检测。

● 为什么选择深度空间蛋白质组技术？
       大多数空间蛋白质组检测技术都是利用抗体探针对目标区域进行靶向蛋白质检测，因此需要研究者根据先验知识预先决定要检测的蛋白panel。然而，目前的蛋白质检测panel包含的蛋白质数量较少，远低于蛋白质组的实际复杂性。因此，需要一种能对空间组织的特定区域进行非靶向蛋白质组检测的技术。SBC的深度空间蛋白质组技术使用质谱技术对蛋白质组进行检测，摆脱了抗体探针检测技术在物种和检测蛋白数量上的限制，是空间蛋白质组研究的不二利器。


● 深度空间蛋白质组技术介绍
> LCM技术
       激光捕获显微切割（Laser capture microdissection，LCM），是在不破坏组织结构，保存要捕获的细胞和其周围组织形态完整的情况下，利用精确聚焦的激光，直接在冰冻或FFPE膜切片上进行切割，从而获得目的区域组织样品，用于后续实验及分析的技术。该技术提供了温和，无污染且高效的样品收集方法，包括在分离期间和分离后的任何步骤进行全面的目视检查。切割时可根据研究目的选择任意的大小和灵活的形状，是空间蛋白质组研究精准捕获目标区域的优秀工具。
> timsTOF Pro技术
       虽然LCM技术可以帮助我们精准获取目标组织区域样品，但这种样品中蛋白质含量普遍较低，因此需要使用高灵敏度和分辨率的质谱仪器进行蛋白质组学检测。引入双TIMS/PASEF® (Parallel Accumulation - SErial Fragmentation平行累积串行碎裂)分离技术的timsTOFﾠPro平台使得蛋白质组学进入了4D蛋白质组学新时代。传统的3D分离技术包括保留时间（retentionﾠtime）、质荷比（m/z）、离子强度（intensity），4D分离技术增加了第四个维度⸺离子淌度（mobility），进而大幅度地提高了扫描速度和检测灵敏度，大幅提升蛋白鉴定的数量和覆盖率。

       上海生物芯片有限公司成立于2001年8月，公司由上海科技创业投资（集团）有限公司、上海张江（集团）有限公司、中科院上海有关院所、上海交通大学等在上海的国内知名大学、研究所、医院和企业共同组建而成，经国家发展与改革委员会批准公司建设和运行“生物芯片上海国家工程研究中心”，是我国生物医药领域规模最大的生物技术国家工程研究中心之一，是全国生物样本标准化技术委员会（TC559）、中国医药生物技术协会组织生物样本库分会（BBCMBA）与中国抗癌协会肿瘤样本整合研究分会的秘书处与主任委员单位。

       通过二十余年的建设和发展，公司（中心）确立了以生物样本库、基因芯片、高通量测序、蛋白芯片、组织芯片、数字化病理、分子病理与生物信息学为核心平台的技术创新服务体系，以分子医学检测技术和分子诊断产品研发生产为核心竞争力的产业化体系，形成科研和药物研发技术服务、分子诊断产品研发生产销售和分子医学检验三大主营业务，公司（中心）具备科研及公共技术平台服务优势、成熟的科技成果转化服务能力、国家工程研究中心品牌影响力等强大的自身资源及优势。