TCGA数据库挖掘

TCGA数据库简介

TCGA，The Cancer Genome Atlas Program，癌症基因组图谱计划，该数据库收录了超过20000例患者，33类癌症的大量数据，主要包括：
1，临床数据。患者的一般信息，TNM分期，生存等
2，mRNA表达谱
3，miRNA表达谱
4，拷贝数变化
5，突变
6，蛋白质谱
7，甲基化

TCGA挖掘常见套路

针对TCGA数据库中的大量数据及相关的二次数据库，我们可以对肿瘤数据进行挖掘：
1，差异表达分析
2，生存分析
3，肿瘤分期分析
4，免疫浸润
5，泛癌分析
6，预后模型

       上海纽科生物科技有限公司是一家集生命科学研究、生物科技服务、产品研发为一体的服务型科技企业。 专注于生物医学领域，致力于为生物医学工作者提供个性化数据分析等服务，提高科研文章的发表效率。

       公司已经和四川大学、复旦大学、上海交通大学、中山医院、华中科技大学等多所医院、高校的研究团队建立了长期良好的合作关系，帮助客户在European Heart Journal、Circulation Research、Nature Communications等多个著名杂志期刊上发表高水平科研文章。