GEO相关服务:
1,芯片数据挖掘。根据芯片类型,计算表达谱,差异基因等
2,高通量测序数据挖掘。根据测序类型,计算表达谱,差异或者peak calling等
3,多组学数据联合分析
4,GEO原始数据上传/下载
TCGA相关服务:
1,特定癌症的表达谱,差异分析
2,Cox回归,生存分析
3,预后模型
4,免疫浸润
转录组相关:
1,GSEA/GSVA分析
2,CNC共表达网络分析
3,ceRNA网络分析,包括LncRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络,circRNA-miRNA-mRNA ceRNA网络等
4,WGCNA分析
5,GO,Pathway分析,常规物种和特殊物种
6,蛋白质-蛋白质相互作用分析
7,hub基因分析
8,circRNA同源分析
9,时序表达分析
10,Venn图
11,PCA分析
小RNA相关:
1,miRNA靶基因预测
2,miRNA-靶基因网络分析
3,miRNA二级结构分析
4,piRNA靶基因预测
测序服务:miRNA-seq
ChIP、MeDIP相关:
1,峰可视化
2,motif分析
3,circos图
MeRIP/m6A相关:
1,m6A和RNA-seq联合分析四象限图
2,相关系数
3,peak venn图
4,circos图
5,motif分析
6,metaplot
eccDNA相关:
1,eccDNA长度分布
2,motif分析
3,染色体分布
4,不同基因组特征分布
其他联合分析:
1,RNA-seq和MeRIP-seq联合分析
2,miRNA-seq和circRNA-seq联合分析
3,mRNA-seq和eccDNA-seq联合分析
个性化作图、分析相关:
1,提供论文例图定制开发
2,提供数据,测试程序等bio-equip.com
公司致力于利用各种组学(基因组、转录组、表观组、表观遗传组、蛋白组、代谢组等)数据和生物信息学数据库、软件工具、在线平台等,帮助研究者了解数据,挖掘数据背后的生物医学知识,发表高水平科研论文,推动生物医学的发展。
我们开发的“微生信云平台”帮助用户0代码在线绘制出版级科研图片,0代码分析实验数据。平台目前拥有超过12w注册用户,google学术引用2000多篇。
