 |
对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序，拼接出最长的转录本为unigene，以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释，全面分析基因表达水平和结构信息。
|
|||||||||||||||||
| [发表评论] [本类其他服务] [本类其他服务商] | ||||||||||||||||||
| 服务商： 上海中科新生命生物科技有限公司 | 查看该公司所有服务 >> |
基于Illumina 测序平台，真核无参转录组测序采用Illumina Hiseq平台，对真核生物特定组织或细胞在某个特定状态下转录的所有RNA进行测序，拼接出最长的转录本为unigene，以unigene为参考序列进行转录本拼接、注释，全面分析基因表达水平和结构信息。
实验流程
应用方向
生物领域各个研究方面，如：
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
▶ 质控严格：严格的质量控制，及时与客户沟通RNA质检结果
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，建库成功率＞98%，数据质量高，Q30＞85%
▶ 分析内容丰富：个性化分析，联合分析，分析内容更丰富
参考文献
1.Prediction of a peptidome for the ecotoxicological model Hyalella azteca (Crustacea; Amphipoda) using a de novo assembled transcriptome. Mar Genomics. 2018
无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析，为生态毒理研究奠定良好的基础。
2.De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017
无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析，更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。
实验流程
应用方向
▶ 农林领域：抗逆胁迫机制，生长发育机制，育种保护研究等
▶ 微生物领域：致病机理，耐药机制，病原体-宿主相互作用研究等
▶ 海洋水产：渔业资源，海水养殖，渔业环境与水产品安全等
▶ 基础医学、临床诊断：生物标志物，疾病机理机制，疾病分型，个性化治疗等
数据分析
| 转录本拼接组装 | 基因表达水平定量 |
| 基因功能注释（7大数据库） | 样品间相关性分析 |
| CDS预测 | 基因差异表达分析 |
| SNP分析、Indel分析 | 差异表达基因功能富集分析 |
| SSR分析 | 差异表达基因的蛋白质互作网络分析 |
| 转录因子注释 | 个性化分析 |
技术优势
▶ 样品类型广泛：动植物组织、微生物、细胞、外泌体等▶ 质控严格：严格的质量控制，及时与客户沟通RNA质检结果
▶ 平台优，数据质量高：基于优质的Illumina测序平台，建库成功率＞98%，数据质量高，Q30＞85%
▶ 分析内容丰富：个性化分析，联合分析，分析内容更丰富
参考文献
无参转录组测序技术-端足虫-通过对端足虫转录组分析，为生态毒理研究奠定良好的基础。
2.De novo assembling and primary analysis of genome and transcriptome of gray whale Eschrichtius robustus. BMC Evol Biol. 2017
无参转录组测序技术-鲸鱼-通过对灰鲸基因组和转录组分析，更好地了解鲸鱼的进化及其适应低氧环境的机制。
手机版：真核无参转录组测序
Copyright(C) 1998-2026 生物器材网 电话：021-64166852;13621656896 E-mail：info@bio-equip.com