small RNA测序

欧易特色

● 高度灵活性：可研究任一17～35 nt之间小RNA分子
● 高度精确性：可精确到单核苷酸水平，非常有利于区分高度同源的小RNA分子和鉴定小RNA的多态性
● 检测动力学范围广：可在超过6个数量级范围内实现准确的序列检测和定量分析，有利于低丰度小RNA差异表达的研究
● 数据质量高：深度测序保证了抽样随机性，可靠性和重复性高，与实时定量PCR结果具有较高的一致性

small RNA测序项目流程

数据分析内容

标准数据分析

● small RNA测序数据预处理 ·数据处理统计 ·Reads长度分布统计·Reads拷贝数统计

● 序列比对注释高质量Ref tag构建

·参考基因组比对 ·miRBase数据库比对注释·Rfam数据库比对 ·Gene比对 ·Repbase比对·Reads分类注释汇总

● 已知miRNA鉴定  ● 新miRNA预测·新miRNA预测 ·新miRNA二级结构预测

● miRNA差异分析（已知/新预测）·miRNA表达量统计 ·miRNA差异筛选

● 差异miRNA靶基因预测（已知/新预测）

·差异miRNA靶基因预测
·差异miRNA靶基因GO富集分析
·差异miRNA靶基因KEGG富集分析

small RNA测序样品要求

● Total RNA：≥2 μg 

● OD260/280为1.8-2.2

● 适用范围：真核生物（有、无参考基因组皆可）