新型RNA原位测序服务

原位测序技术(In Situ Sequencing,ISS)依赖于锁式探针和滚环扩增技术，它是以缺口靶向(Gap-targeted Sequencing)或条形码靶向(Barcode-targeted Sequencing)为测序策略，同时引入边连接边测序的化学原理（Sequencing-by-ligation Chemistry)，以滚环扩增产物为测序媒介进而在组织或细胞原位对RNA实现短片段测序的技术。通过4轮连续测序成像一次性最多可以检测出256种靶标mRNA分子。

技术流程

(1)定制探针：针对用户提供的基因的非保守区设计探针并合成

(2)样本前处理：将冰冻切片退冻、固定、脱水和透化，以便探针和反应所需的酶等成分进入组织细胞内部

(3)探针杂交与滚环扩增：探针与RNA杂交，之后连接成环；通过滚环扩增反应放大编码信号

(4)原位成像：利用边合成边测序的化学原理，通过采集荧光信号得到对应位置的编码碱基；经过序列解码，可识别出该位置靶向结合的基因

(5)图像分析：获得每个靶基因在组织中的空间表达位置，用不同符号(或颜色)标记在同一张组织图像中；通过细胞边界识别等方法得到单细胞水平的基因表达定量数据，可进行高级分析

产品优势

创新技术：无需反转录成cDNA，探针特异性结合mRNA，大大提高基因检出效率

高灵敏度：每个基因设计3~5对双连接探针，低丰度表达基因依旧高效检出

广泛适应：适用于冷冻OCT包埋及石蜡包埋组织样本或者切片，细胞爬片样本等

个性定制：用户自定义基因panel设计，支持最多256个基因

高分辨率：最高120nm分辨率，亚细胞水平定位RNA

应用多样：器官发育、神经科学、肿瘤免疫、病原感染、药物开发等领域

德运康瑞是一家单细胞与空间多组学技术平台型企业，致力于推动精准医疗向单细胞与空间组学时代迈进。公司可为用户提供从样本解离、细胞捕获、文库构建、测序分析、数据挖掘的一站式全流程单细胞与空间多组学综合解决方案，目前已与40余家知名高校及医院客户建立业务合作。