甲基化450K芯片分析

    Illumina Human Methylation 450K BeadChip芯片可检测人全基因组近450,000个甲基化位点，具有单碱基的分辨率。全面覆盖了96%的CpG岛，并根据需求加入了CpG岛以外的CpG位点、人类干细胞非CpG甲基化位点、正常组织与肿瘤（多种癌症）组织差异甲基化位点、编码区以外的CpG岛、miRNA启动子区域和GWAS疾病相关区域的位点，同时覆盖了Human　Methylation27 BeadChip的90%的位点。每张芯片可平行进行12个样本的检测。Illumina Human 甲基化450K芯片集合了覆盖全面、高通量、高分辨率和高性价比等优点，广泛应用于干细胞研究、肿瘤和其他疾病研究。 

技术优势

★覆盖全面：可以检测≧485,000个甲基化位点，覆盖了99%的RefSeq Genes，96%的CpG islands。设计的位点包括CpG岛或CpG shores位点，CpG岛外的CpG位点，在人类干细胞中观察到的非CpG岛甲基化位点，肿瘤与正常组织相异的甲基化位点，包括多肿瘤及不同的组织类型，非编码区CpG岛位点，miRNA启动子区域以及由GWAS发现的疾病相关区域位点，这些位点覆盖了绝大多数研究者的需求。
★分辨率高：单碱基分辨率，可以直接检测到发生甲基化的准确位点
★操作简单：无需进行烦琐的“甲基化DNA免疫共沉淀”，亚硫酸氢盐处理基因组DNA即可进行芯片检测
★可重复性高：技术重复相关系数R2 ≈0.99
★可靠性高：与“全基因组亚硫酸氢盐-测序”相关系数R2>0.9597
★价格相对全基因组Bisulfite甲基化测序便宜

技术路线

生物信息分析

Illumina Human 甲基化450K芯片分析生物信息分析流程

研究内容

l 标准信息分析

1. 原始数据统计、质量控制及过滤

2. 计算可检测位点的甲基化水平

3. Copy Number分析

4. 甲基化区域识别（两组以上样本）

5. 差异甲基化基因鉴定（两组以上样本）

6. 差异甲基化基因GO富集分析

7. 差异甲基化基因KEGG pathway分析

l 高级信息分析

1. 450K芯片数据与小RNA联合分析

2. 450K芯片数据与mRNA表达数据联合分析

        上海美吉生物医药科技有限公司专注于新一代DNA高通量测序技术的应用和推广、生物信息分析、临床诊断试剂盒研发和转化医学研究，是上海张江高科技园区、张江药谷重点支持企业，华东师范大学战略合作单位。目前，美吉生物在上海、北京、广州三个一线城市建立了实验基地，销售网络遍布全国各地。

        美吉生物拥有世界一流的测序平台，在ABI3730xl常规测序平台的基础上，先后引进了罗氏454高通量测序平台和Illumina高通量测序平台，专业提供动植物基因组测序、微生物基因组测序、宏基因组测序、转录组测序、小RNA测序、基因表达谱分析等技术服务。

        美吉生物拥有一支实力雄厚的技术团队，有从事分子生物学研究十多年、经验丰富的技术骨干，也有创新进取、拼劲十足的希望之星。技术团队经验丰富，曾参与水稻、番茄、家蚕等多项大型基因组学项目，可以为您提供专业、合理、高性价比的实验方案。

        生物信息学是国际前沿的新兴学科，近年来发展迅猛。美吉生物拥有一支具有国际一流水平的生物信息分析团队，不仅可以提供标准流程化的生物信息分析，还可以根据不同的课题需求，提供个性化的深度数据挖掘。

        B2B(Bench to Bedside)的转化医学模式，大大缩短了医学科学从基础研究到临床应用的时间，加速了人类进入基因组医学时代的步伐。基于对未来医学发展趋势的充分理解，美吉生物和国内多家著名三甲医院联合建立了转化医学中心，开展转化医学研究，以迎接基因组医学时代的到来。

        美吉生物秉承“专业、卓越”的企业理念，“以客户为本，让客户满意”的服务宗旨，一如既往地致力于提供高品质、高效率的技术服务，努力将公司打造成为国内一流企业。因为敬业，所以专业；因为专业，所以选择；选择美吉，选择满意！