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DNA甲基化芯片分析
DNA甲基化,表观遗传学,甲基化芯片
服务类别:芯片与生物信息学总访问:1814
最后更新:2010-11-8半年访问:46
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芯片质量控制 (Quality control)     通过对数据的各项指标的分析作图,可以评估芯片实验质量,了解数据的分布规律,并为下一步分析方法提供参考。
 

生数据标准化 (Raw data normalization)    对原始数据进行处理,通过特定的统计分析,达到消除背景噪音,过滤脏数据,去除同一实验不同block之间、不同芯片之间的实验误差,使不同芯片的数据具有可比性。下图为数据标准化前(左图)后(右图)数据的盒图,表示各芯片数据的数值分布。
 

差异甲基化区域鉴定(Differential methylation region identification)   差异甲基化区域鉴定是为了发掘样本中显著高甲基化或者低甲基化的位点。

甲基化差异区域基因富集分析 (Gene enrichment analysis in differential methylation region)
 

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