OCT包埋胶/样本包埋/空间代谢组学/单细胞核测序/珍贵样本保存方案

如果你的样本极其珍贵，样本保存就更为关键。
以下是样本保存的几种方案
 
第一：组织分割分区保存
如果样本量允许，可以将组织分成几份。

• 一份按常规液氮速冻，用于普通分子实验。
• 一份用组织冻存液梯度冻存或直接制备成单细胞悬液冻存，为单细胞测序留路
• 一份用OCT包埋，干冰速冻后-80℃保存，用于空间转录组或冰冻切片。

这样即使后续研究方法变化，也有对应的样本可用。
 
第二：优先考虑单细胞核的保存方案
如果组织本身很少无法分割，又想兼顾单细胞和常规测序，液氮速冻的组织，后续可以做单细胞核测序
 
第三：优先考虑空间组学的保存方案
如若后续做空间组学的可能性更大，建议优先采用OCT包埋干冰速冻的方式。如若还可能做空间代谢，最好采用鑫乐包埋胶(货号xinle-hc0019)代替OCT包埋。OCT和鑫乐包埋胶包埋的样本，除了做空间组学，还可以用于单细胞核转录组测序


第四：石蜡包埋样本的利用，对于已经石蜡包埋的样本，既可以做空间转录组测序，10x HD、Xenium 、华大Stereo-FFPE,也有单细胞测序方案10x Flex，可以从福尔马林固定的石蜡样本中，提取细胞核进行单细胞测序，这为大量临床存档样本的再利用提供了技术支撑，但需要专用试剂盒和优化的解离步骤，需要注意的是，组织固定的时间，一般建议是18-24小时，不能固定过久。
此外，无论采用哪种保存方式，详细的实验记录都很重要，包括：离体时间，速冻方式，保存温度，是否使用OCT，冻存时间长短等，这些信息，在后续实验出现异常或失败时，能帮助判断，问题是出在样本本身还是实验操作上。
 
对于珍贵样本，建议在正式实验前先做少量测试，确定质量可行后，再推进大规模实验。

以上资料供大家叁考，若有需要补充或分区更为细致，可沟通交流，联系上海鑫乐生物。