盘古快速荧光定量PCR 助力研究应用——9月文献精选

肿瘤与糖尿病并发症研究，是本期9月文献精选的两条主线。5篇研究分别聚焦胃癌、口腔鳞状细胞癌、肺腺癌、糖尿病肾病及糖尿病性心肌病，涉及预后模型构建、表观遗传调控、自噬、铁死亡及RNA稳定性等研究方向。盘古Pangaea快速荧光定量PCR平台在这些研究中承担了基因表达检测与验证工作，为不同疾病的分子机制研究提供实验数据支持。

研究方向

整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq构建胃癌淋巴管生成相关预后模型，并解析APOA1、SERPINE1、CD36、NPTX1和IGFBP1与胃癌免疫微环境及预后的关系。

盘古荧光定量PCR应用

对胃癌临床组织进行RT-qPCR，检测APOA1、SERPINE1、CD36、NPTX1和IGFBP1五个预后基因的mRNA表达。

关键发现

通过bulk RNA-seq、单细胞RNA-seq及生存分析筛选出APOA1、SERPINE1、CD36、NPTX1和IGFBP1五个胃癌淋巴管生成相关预后基因；基于这五个基因构建的风险模型可对胃癌患者进行预后分层，并与免疫浸润、免疫检查点表达及治疗敏感性相关；临床RT-qPCR进一步验证了SERPINE1升高以及APOA1、CD36降低。

研究方向

KAT2B通过增加GSTZ1启动子H3K9ac修饰激活GSTZ1转录，从而调控口腔鳞状细胞癌增殖、肿瘤干性及铁死亡敏感性的表观遗传机制。

盘古荧光定量PCR应用

检测KAT2B、GSTZ1以及肿瘤干性相关基因SOX2、NANOG、ALDH1A1的mRNA表达，验证KAT2B过表达/敲低效率和临床OSCC组织中的KAT2B表达，评价KAT2B对肿瘤干性基因及GSTZ1转录的影响。

关键发现

KAT2B在OSCC组织和细胞中显著低表达并发挥抑癌作用；KAT2B过表达可抑制细胞增殖、肿瘤球形成和干性，同时提高RSL-3诱导的铁死亡敏感性。机制上，KAT2B结合GSTZ1启动子并增强H3K9ac修饰，促进GSTZ1转录；GSTZ1进一步抑制NRF2/GPX4抗氧化/抗铁死亡通路，使Fe²⁺和脂质ROS积累。敲低GSTZ1能够逆转KAT2B的抗增殖和促铁死亡作用。

研究方向

RUNX2通过转录激活TMEM74促进肺腺癌细胞保护性自噬，进而增强细胞增殖并抑制凋亡的分子机制。

盘古荧光定量PCR应用

检测TMEM74和RUNX2的mRNA表达，验证TMEM74敲低/过表达模型、RUNX2过表达效率，并检测RUNX2过表达后TMEM74转录水平的变化。

关键发现

TMEM74在LUAD中高表达且与较差预后相关；TMEM74通过增强自噬通量促进肺腺癌细胞增殖并抑制凋亡，自噬抑制剂Bafilomycin A1可削弱这一作用；RUNX2与TMEM74表达正相关，并可直接增强TMEM74启动子转录活性；敲低TMEM74可以逆转RUNX2过表达引起的促增殖、抗凋亡和促自噬效应。

研究方向

PTBP3通过结合并稳定SMAD3 mRNA促进足细胞上皮-间质转化，从而推动糖尿病肾病肾纤维化和肾功能损伤的分子机制。

盘古荧光定量PCR应用

检测PTBP3和SMAD3的mRNA表达，主要用于验证糖尿病肾病小鼠肾组织、高糖刺激MPC5足细胞中的PTBP3表达变化、PTBP3敲低效率，以及PTBP3干预后SMAD3 mRNA表达的变化。

关键发现

PTBP3在糖尿病肾病肾组织及高糖刺激足细胞中异常升高；敲低PTBP3可降低尿蛋白、肌酐和BUN，改善足细胞损伤和肾纤维化。PTBP3直接结合SMAD3 mRNA 3′UTR并提高其稳定性，从而增加SMAD3和p-SMAD3水平、促进SMAD3核转位以及足细胞EMT。

研究方向

YTHDF3通过识别m6A修饰并稳定TRIM47 mRNA，促进心肌脂质积累、炎症和心肌细胞损伤，从而加重糖尿病性心肌病的分子机制。

盘古荧光定量PCR应用

检测基因包括TRIM47、YTHDF3、TNF-α、IL-6、IL-1β、ANP、BNP和β-MHC，参与了TRIM47在糖尿病心肌和PA处理心肌细胞中的表达验证、TRIM47敲低效果检测、心肌肥大/损伤及炎症基因表达分析，以及YTHDF3-TRIM47调控关系的qPCR研究。

关键发现

TRIM47在糖尿病心肌中显著升高，是促进糖尿病性心肌病的重要致病因子；心肌细胞特异性敲低TRIM47可改善LVEF和LVFS，减轻心肌肥大、纤维化、炎症和凋亡，并显著降低心肌脂质及TG积累和CD36表达。

结语

从胃癌临床组织中预后相关基因的表达验证，到肿瘤细胞中基因干预效果检测，再到糖尿病模型中炎症、心肌损伤及相关调控因子的表达分析，盘古的应用覆盖了临床组织、动物模型与细胞实验，这些文献的发表让产品价值有了具体的依托。盘古将持续以稳定可靠的检测性能服务科研需求，助力更多实验室深入探索生命机制，产出高质量研究成果。