生物样本库核酸样本质控方法

生物样本库（Biobank），又被成为生物银行。根据经济合作与发展组织(OECD)的定义，"生物样本库(Biobank)是一种集中保存各种人类生物材料(Human biological material)，用于疾病的临床治疗和生命科学研究的生物应用系统"。根据GB/T 37864-2019《生物样本库质量和能力通用要求》等指导文件，生物样本库必须做好核酸质控，包括对DNA，RNA样本的纯度，浓度以及完整性做好检测。

 

 

核酸样本质控方法推荐

根据GB/T40974-2021《核酸样本质量评价方法》，分别对DNA和RNA样本的浓度、纯度、完整性提出了推荐的质控方法。

• 浓度：分光广度法、荧光染料检测法 荧光定量 PCR法和数字 PCR法
• 纯度：分光光度法和 琼脂糖凝胶电泳法
• 完整性：凝胶电泳法， 毛细管凝胶电泳法（安捷伦Tapestaion分析仪） 和微流控分析法（安捷伦2100生物分析仪）

 

核酸样本质控

1、安捷伦2100生物分析仪

2100生物分析仪是核酸质控届的常青树，是国际生物和环境样本库协会（ISBER）《生物样本库最佳实践》，GB/T 40664-2021《用于高通量测序的核酸类样本质量控制通用要求》，GB/T 40974-2021《核酸样本质量评价方案》等指导文件中推荐的生物样本库核酸质控方法。

2100生物分析仪采用微流控芯片技术，样本进入芯片后，进行电泳分离。使用数字化评价体系，评估样本质量，其中RNA完整性指标RIN值是业内公认的金标准。

 

图 1 微流控芯片示意图

 

2、安捷伦Tapestation 分析仪

Tapestation 是安捷伦旗下推出一款独创的胶条式自动化电泳分析仪，也是国内外众多生物样本库核酸质控的选择。这款仪器自动化程度非常高，用预制胶条取代传统繁琐的制胶过程，胶条采用独立泳道，有效避免污染。

 

图 2 Tapestation 预制胶条

 

Tapestation 共有两款型号，提供灵活通量，减少单次上机成本。

 

• 4150 TapeStation

– 从两个 8 联管上样

– 完整的可扩展性：可分析 1–16 范围内任意数量的样品

– 16 个样品在 20 分钟内即可获得可靠且可重现的结果

– 占地面积小，节省宝贵的实验室台面空间

 

• 4200 TapeStation

– 可对多达 96 个样品进行全自动样品处理

– 从两个 8 联管或一个 96 孔板上样

– 完整的可扩展性：可分析 1–96 范围内任意数量的样品

– 1–2 分钟内即可获得一个样品的可靠重现结果，90 分钟内可获得 96 个样品的结果

 

图 3 Tapestation 分析仪 ，型号4150（左），型号4200（右）

 

Reference：

1、GB/T 37864-2019《生物样本库质量和能力通用要求》

2、GB/T 40974-2021《核酸样本质量评价方案》

3、安捷伦5991-3143ZHCN