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敏芯科技为您提供甲基化芯片数据分析服务
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甲基化芯片分析方案
项目一、原始数据的处理及归一化（必选）
为了消除实验的误差、生物样品个体差异及噪声等产生的影响，将数据进行归一化处理。
项目二、芯片探针重注释（条件必选）
如果该芯片中的探针注释并非由基因组序列设计产生，而是由实验克隆测序直接生成序列，在向基因组BLAST比对的时候，有时会没有对应。需要对其进行重新注释，获得探针的基因组序列。
项目三、基因重注释（条件必选）
我们将原有的基因列表进行了重新注释，原有的注释一般只提供了CpG岛位于哪个基因之内，即within, 实际上一个启动子的范围要大得多，因此我们加入了一些CpG岛上游（upstream）和下游基因(downstream)的注释。
项目四：差异CpG岛的筛选（必选）
取表达2倍差异的基因：
项目五：转录因子预测分析（推荐）
] 扫描CpG岛区域的转录因子结合位点。因为一般情况下甲基化会使转录因子与DNA的结合力下降，导致基因转录水平的降低。因此转录因子的分析可以解释甲基化导致转录抑制的机理。
项目六：甲基化显著基因的Gene Ontology分析（推荐）
项目七：甲基化显著基因的pathway分析（推荐）
项目八：基因关联网络构建（可选）
项目九：甲基化与基因表达的相关性分析（可选）
详情请查看公司网站：www.sensichip.com.cn
手机版：甲基化芯片数据分析服务
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