454测序技术服务（第二代测序）

454测序技术服务(GS FLX系统超高通量测序)

特色 

Ø    支持各种不同来源的样品：包括基因组DNA，PCR产物 
Ø    BAC，cDNA，小分子RNA等等 

Ø    提供了完整的从样品制备到后续的生物信息学分析解决方案 

Ø    为目前遗传分析和功能基因组等热门研究领域的部分热门课题 

Ø    提出了全新的应用方案。针对不同客户的不同需求，量身定做不同的测序解决方案

原理  

       454 GS FLX 基因组测序仪的原理是通过焦磷酸盐测序原理与微流体技术的整合。它是一种新的依赖生物发光进行 DNA 序列分析的技术，在 DNA 聚合酶、 ATP 硫酸化酶、荧光素酶和双磷酸酶的协同作用下，将引物上每一个 dNTP 聚合与一次荧光信号释放偶联起来，通过检测荧光的释放和强度，达到实时测定 DNA 序列的目的，此技术不需要荧光标记的引物或核酸探针，也不需要进行电泳，具有分析结果快速、准确、灵敏度高和自动化的特点。 

服务流程 

Ø    剪切、连接：基因组DNA“剪切”成300－800个碱基的片断，然后和两个衔接子A、B进行平端连接。A、B 衔接子各自含有20个碱基的PCR 引物序列、20个碱基的测序引物序列和4个碱基的对照序列（TACG），除此之外，B衔接子的5’端还标记有一个生物素基团，供后续的分离合适的测序模板使用 

Ø    单链DNA模板的分离 

Ø    emPCR （emulsion PCR）：仅含有A、B衔接子单链DNA模板和过量的DNA 捕捉珠子退火结合，并被吸附到一种用于PCR反应的油-水混合物的小滴上，以单链的DNA为模板进行PCR扩增，结果得到大量同一序列的DNA链 
Ø    测序反应 

提供服务 

Ø     全基因组测序 

（1）多达120 Mb的未知基因组的测序  
－生成基因组结构概图 
－研究DNA序列的组织，分布和信息 
－基因筛查：寻找新基因，定位和功能 
－和其他基因组进行比较研究   
－识别单碱基突变 
－识别突变热点和保守区域 
－识别插入或者缺失的基因 
－断定基因型和表型之间的相关关系（比如，研究药物抗性的遗传基础）  
－基于基因测序变化进行毒性预测 
－进行流行病学分析 
－了解工业生产菌株和它们的亲代菌株序列上的差异作为进行工业生产菌株开发的遗传基础 
－进行宏基因组 （metagenomics）研究 
－古代化石DNA 测序研究 
（2）比较基因组及分子进化分析：序列同源比对、通过相邻物种的比较基因组研究进行进化分析、基因注释、功能分类等        
（3）利用配对末端方法（Pair-End Tag）将Contigs拼接成Scaffolds。 
  
Ø    转录组和基因调节研究 

（1）基于短Tags，ESTs, ChIP，或者GIS-PET序列的高通量转录组分析，或者miRNA 序列的基因组范围识别，小分子和非编码RNA的测序。 
（2）研究DNA的甲基化模式来进行基因调节的研究。  
Ø    扩增产物分析 

PCR产物的超精细测序（应用于医学研究的重测序）  
－在混合的肿瘤样本中识别体细胞突变 
－在群体水平上发现高可信度的SNP位点   
Ø    信息分析 

（1）基本信息分析：图像识别，basecalling，过滤接头序列，检测可能的样品污染。  
（2）高级信息分析  
A 基因组注释：包括基因组组分分析、基因预测、重复序列注释、Non-coding RNA预 测和假基因（Pseudogene）注释等。 
B 基因的功能注释及分类: 通过比对软件（Blast系列软件包）与公共数据中序列做同源性联配，在保证严格置信度标准前提下，对基因进行功能注释。最全面数据库的使用，保证所得数据与国际同步，最大限度挖掘基因组信息。

北京诺赛基因组研究中心有限公司（诺赛基因）是基于基因组学研究的生物高科技企业，公司的发展目标是实现最新生物医药研究成果的产业化。诺赛基因致力于自有知识产权的创新药物的开发，生物标志的鉴定与疾病诊断/预警检测技术的研发，生物制品与试剂的生产，中国人群遗传资源和临床资源的收集、保护、利用与开发，以及生物科技领域相关技术的培训、咨询和服务。

1998年9月，北京诺赛基因组研究中心有限公司由北京生物技术和新医药产业促进中心和北京博大科技投资开发有限公司投资，中国医学科学院/中国协和医科大学、北京大学、中国科学院、军事医学科学院等单位参与组建成立。

诺赛基因开展与人类疾病相关的基因组学、功能基因组学和蛋白质组学研究。1998年10月，国家科技部批准在诺赛基因的基础上成立国家人类基因组北方研究中心，作为国家级研究基地。

诺赛基因自成立以来，整合以北京为中心的科研院所以及临床医院在基因组学及相关领域的科研力量，建立了具有世界级水平的生物学研究实验室，组建了包括8位院士在内的、由26位生物和医药领域资深科学家组成的智囊团，组织并培养了一支由近百名科技人员组成的具有丰富研发经验的科研团队。

诺赛基因现已成功完成和正在进行863、973等国家重点课题及合作项目74项，参与并完成了1%国际人类基因组测序项目，承担了致病微生物基因组测序、中国人群单核苷酸多态性（SNP）检测及疾病基因组学研究等多项国家科研项目。截止目前，诺赛基因已申请专利28族。