全长鸟枪法测序

   全基因组测序主要有二种策略,一种是分级鸟枪法测序,另一种是全基因组鸟枪法测序.微生物是一种十分重要的遗传资源,运用全基因组鸟枪法可以方便、快捷地完成其基因组的测序任务.。

       信利来公司拥有ABI3730xl测序平台和齐全的配套设施，其全基因组鸟枪法测序（Whole Genome Shotgun Sequencing），无需构建各类复杂的物理图谱和遗传图谱，采用最经济有效的实验设计方案，直接将整个基因组打成不同大小的DNA片段构建Shotgun文库，对文库进行随机测序，最后运用生物信息学方法将测序片段拼接成全基因组序列。信利来公司测序平台目前已经完成十余例50kb到500kb大小基因组测序服务项目，积累了丰富的经验。

   全基因组鸟枪法测序的主要步骤是：第一，建立高度随机、插入片段大小为1.6kb到4kb左右的基因组文库。克隆数要达到一定数量，即经过两端测序的克隆片段的碱基总数应达到基因组大小的6到10倍。第二，高效、大规模的克隆双向测序。第三，序列拼装。借助Phred, Phrap, Consed 软件进行序列组装，产生一定数量的contig。第四，填补缺口。有两种待填补的缺口，一是没有相应模板DNA的物理缺口，我们通过PCR的方法进行填补；二是有模板DNA但未测到的序列缺口。我们直接在模板DNA上设计引物测序。

项目适用范围

BAC、Fosmid、cosmid、线粒体、叶绿体等

服务内容

基本服务内容：shotgun文库构建，大规模测序，序列组装。
高级服务内容：信息处理和分析，包括比较基因组、基因功能注释和分类。

样品要求

   动物、植物、微生物组织请提供足量的新鲜样品（4℃保存，不超过一天）或将新鲜样品立即存于液氮或-80℃，一周内寄样。

   已纯化 DNA要求浓度＞10ng/ul ，最小量＞20ug，OD 260 /OD 280值：1.80～2.00

服务费用

基因组文库构建不收取任何费用。

大规模测序，基因组组装的费用按照基因组碱基数收费，收费标准为0.8元/碱基。

BAC： 8.5万元人民币    完成时间：3个月

Fosmid：3.5万元人民币    完成时间：2个月

cosmid：3.5万元人民币     完成时间：2个月

生物信息：免费