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基因组生物信息学分析

基因组生物信息学分析


基因组生物信息学分析
通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个微生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘微生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。
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最后更新:2009-9-15半年访问:34
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基因组生物信息学分析

    通过生物信息学的方法解读微生物的基因组信息,使人们迅速得获得一个微生物的大部分基因功能信息;利用获取的信息与已知的近缘微生物基因组进行比较分析,进一步挖掘序列背后的生物学意义,为生物学家提供指导。

    功能基因组注释
    基因预测 
    基因功能注释 
    蛋白质功能分类
    蛋白质亚细胞定位
    rDNA和tRNA基因预测
    IS element和Prophage预测

    功能基因组分析
    Paralog和Ortholog计算
    代谢通路的构建
    基因岛和水平转移基因的发现
    基因组多态性的分析
    基于同源基因的DN/DS计算的进化分析

    cDNA文库分析 
    原始序列前期处理 (去除载体,低质量序列,污染等)
    文库随机性检测
    文库基因饱和度预测
    序列聚类拼接
    基因注释 (功能注释,结构域预测等)
    功能分类(GO,MIPS等)
    基因表达量分析
    文库基因总体分析(KEGG代谢途径)
    基因可变剪接分析
    文库之间相互比较
    自动化分析平台构建

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