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蛋白质组学Label Free分析服务

蛋白质组学Label Free分析服务


Label Free analysis service for proteomics
蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,即可对肽段对应的蛋白质进行相对定量。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:747
最后更新:2020-5-25半年访问:52
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  • 服务介绍
  • 公司简介

       蛋白质非标记定量技术(label-free)是通过液质联用技术对蛋白质酶解肽段进行质谱分析,无需使用昂贵的稳定同位素标签做内部标准,只需分析大规模鉴定蛋白质时所产生的质谱数据,比较不同样品中相应肽段的信号强度,从而对肽段对应的蛋白质进行相对定量。

技术路线
       基于质谱的非标记定量技术主要包括两种:一种是根据一级质谱相关的肽段峰强度(peak intensity)和峰面积(peak area)等信息进行蛋白定量,即以MS1为基础,计算每个肽段的信号强度在LC-MS色谱上的面积积分;另一种是根据蛋白质对应肽段的二级质谱总数(spectral counts)进行蛋白定量,这种方法发展比较早,已经形成多种定量算法,但主要原理都是以MS2的鉴定结果为定量基础,各种方法的差别在于后期算法在大规模数据上的修正。

技术优势

  • 无需昂贵的同位素标签做内部标准,实验耗费低。

  • 对样本的操作最少,从而使其最接近原始状态。

  • 不受样品条件的限制,克服了标记定量技术在对多个样本进行定量方面的缺陷。

  • 对实验操作稳定性、重复性要求高,要求至少做三次技术重复或生物重复;

  • 准确性较标记定量差,对液相色谱串联质谱的稳定性和重复性要求较高。

同位素标记和非标记定量的比较

 同位素标记  非标记定量
 样本标记同位素  样本非标记
 在大样本过程中,难于追踪蛋白丰度  易跟踪蛋白丰度
 低丰度蛋白识别有限  能够鉴别低丰度蛋白
需提前进行二级质谱蛋白鉴定  可以鉴定差异后再进行二级质谱蛋白鉴定
 实验重复性高  实验重复性低

 

技术平台

Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™ Tribrid™

应用领域

  • 机理和调控机制研究

  • 动态过程中机制研究

  • 疾病标志物的筛选

  • 用药及预后标志物筛选

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