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降解组测序
miRNA主要通过诱导靶mRNA的降解来发挥其调控作用。降解组测序可以高通量地检测由miRNA介导的剪切降解的mRNA片段。
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最后更新:2021-8-19半年访问:56
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  • 服务介绍
  • 公司简介
miRNA主要通过诱导靶mRNA的降解来发挥其调控作用。降解组测序可以高通量地检测由miRNA介导的剪切降解的mRNA片段,结合生物信息学分析,可以准确地鉴定miRNA靶基因,揭示miRNA-靶mRNA的复杂调控网络,促进miRNA的功能研究。云序生物提供降解组测序、miRNA测序、miRNA-qPCR、miRNA mimics和miRNA inhibitors等整套miRNA研究工具,为miRNA功能研究提供系统性解决方案。
 
技术优势:
  • 通量高:可以平行鉴定数千条miRNA靶基因剪切产物,效率远远胜过传统的5’RACE方法
  • 准确性高:结合生物信息学分析,可以精确识别miRNA剪切位点,摆脱了仅利用生物信息学预测靶基因的低准确性和高假阳性
  • 灵敏度高:可准确检测低丰度的miRNA靶基因降解产物
  • 实时更新的miRNA数据库信息:利用实时更新的miRBase数据库进行靶基因的分析鉴定
 
数据分析
基本分析 高级分析
1.  原始数据整理,过滤和质量评估 CS-DEG-001.  mRNA降解片段鉴定
2.  基因组匹配与数据统计 CS-DEG-002.  统计mRNA降解位点信息
3.  与rRNA、tRNA、snRNA、snoRNA等ncRNA数据库比对 CS-DEG-003.  鉴定与mRNA降解相关的miRNA
4.  对降解片段进行分类注释 CS-DEG-004.  降解mRNA的GO和通路网络分析
5.  分析样品间的公共序列及特有序列 CS-DEG-005.  miRNA-降解mRNA GO网络分析
6.  探索降解片段在选定的参考基因组上的分布 CS-DEG-006.  miRNA-降解mRNA 信号通路网络分析
 
数据展示
上图:Let-7b介导的降解片段
 
云序生物技术服务列表
1. 测序服务
转录组 表观遗传组 基因组
真核生物 原核生物
miRNA测序 细菌sRNA测序 MeDIP测序 目标序列靶向测序
小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA) 原核生物mRNA测序 RRBS测序 外显子组测序
lncRNA测序 宏转录组测序 全基因组甲基化测序 人类基因组重测序
环状RNA测序 原核生物转录组测序 ChIP测序 16S rDNA测序
mRNA测序 原核De novo转录组测序   宏基因组测序
RIP测序      
降解组测序      
转录组测序      
De novo转录组测序      
 
2. 生信服务 & PCR技术服务
生信服务 实时定量PCR服务
转录组 表观遗传组 基因组 联合分析
环状RNA分析 DNA甲基化分析 基因组分析 circRNA-miRNA 功能分型PCR芯片
lncRNA分析 ChIP测序分析 微生物菌落分析 LncRNA-mRNA 环状RNA实时定量PCR
mRNA分析   宏基因组分析 LncRNA-miRNA-mRNA LncRNA实时定量PCR
microRNA分析       miRNA实时定量PCR
细菌sRNA分析       mRNA实时定量PCR
宏转录组分析        
 
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