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小RNA测序(miRNA + piRNA + siRNA)
云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA,为研究small RNA的功能和调控机制,或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。
服务类别:测序/合成总访问:8140
最后更新:2021-8-19半年访问:384
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  • 服务介绍
  • 公司简介

     Small RNA是一类长度为18-30 nt,具有调控功能的非编码小RNA的总称。常见的small RNA主要包括:microRNA、siRNA和piRNA等。Small RNA广泛参与包括细胞生长、分化、凋亡在内的几乎所有生理过程,并与包括癌症在内的各种人类疾病相关。

    云序生物Small RNA组测序服务可以在一次实验中同时检测所有small RNA,为研究small RNA的功能和调控机制,或者筛选新的small RNA提供了强有力的工具。此外,云序生物还提供仅针对miRNA的测序服务,有效富集miRNA,在相同成本下提高了miRNA有效数据量和测序深度。

详见:云序生物 小RNA测序服务

 

技术优势

  • 全物种覆盖:无需预知序列信息,可对任意物种的small RNA组进行检测
  • 同时检测miRNA、piRNA和siRNA:在一次实验中同时检测miRNA、piRNA、siRNA和其它small RNA
  • 实时更新的small RNA数据库信息:可随时利用最新的small RNA数据库对数据进行再分析,数据永久有效
  • 灵敏度高:可检测在单个细胞中仅一个拷贝的低丰度small RNA
  • 精确度高:可准确区分单碱基差异的small RNA

 

数据分析

基本分析

高级分析

1.  数据过滤和接头序列去除

CS-MIR-001.  miRNA靶基因预测

2.  序列匹配与数据统计

CS-MIR-002.  miRNA靶基因的GO与信号通路分析

3.  已知小RNA(miRNA/siRNA/piRNA)识别,注释和统计

CS-MIR-003.  miRNA-靶基因GO网络分析

4.  小RNA表达量计算

CS-MIR-004.  miRNA-靶基因信号通路网络分析

5.  差异小RNA筛选

CS-MIR-005.  miRNA上游转录因子分析

6.  小RNA表达聚类分析

CS-MIR-006.  新miRNA预测

 

CS-MIR-007.  miRNA分子标志物筛选

 

数据展示

 

云序服务内容

1. 测序服务

转录组

表观遗传组

基因组

真核生物

原核生物

miRNA测序

细菌sRNA测序

MeDIP测序

目标序列靶向测序

小RNA测序(miRNA, piRNA,siRNA)

原核生物mRNA测序

RRBS测序

外显子组测序

lncRNA测序

宏转录组测序

全基因组甲基化测序

人类基因组重测序

环状RNA测序

原核生物转录组测序

ChIP测序

16S rDNA测序

mRNA测序

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