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酶切简化基因组测序

酶切简化基因组测序


RAD-seq (Restriction-site associated DNA-sequnencing)
基于酶切的简化基因组测序技术即RAD-seq,是利用限制性内切酶对基因组进行酶切,结合一定大小的插入片段文库,对酶切获得的RAD标签序列进行高通量测序的技术。
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最后更新:2015-8-4半年访问:54
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酶切简化基因组测序
基于酶切的简化基因组测序技术即RAD-seq (Restriction-site associated DNA-sequnencing) ,是利用限制性内切酶对基因组进行酶切,结合一定大小的插入片段文库,对酶切获得的RAD标签序列进行高通量测序的技术。该方法可以大幅降低基因组的复杂度,具有操作简便,不受参考基因组限制的优点。采用RAD-seq技术,可以快速鉴定SNPs信息,用于群体进化分析、多态性图谱构建、遗传图谱构建(QTL 定位)、性状关联分析等方面,被广泛应用于系统进化、分子育种、种质资源鉴定等领域,特别适合于没有参考基因组的大样本分析。

项目流程(参照如下)

信息分析(参照如下)


简化基因组重测序

简化基因组de novo测序

交付结果
数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析
报告:详细的统计图表和方法描述

 

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