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动植物全基因组重测序-群体

动植物全基因组重测序-群体


nimal and plant genome sequencing - group
生物体不同个体、不同亚群之间存在大量的SNP、Indel、SV等变异信息,通过对这些差异个体进行基因组测序,可以获得各个亚群的基因差异信息,有助于用户讨论群体遗传结构。
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最后更新:2015-8-4半年访问:58
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动植物全基因组重测序-群体
生物体不同个体、不同亚群之间存在大量的SNP、Indel、SV等变异信息,通过对这些差异个体进行基因组测序,可以获得各个亚群的基因差异信息,有助于用户讨论群体遗传结构,研究遗传平衡以及影响群体遗传平衡的因素,解析物种形成的机制,探讨生物进化的机制等。

 

基因是具有遗传效应的DNA分子片段,其中90%的遗传信息的差异都取决于SNP。SNP 在动植物基因组中分布广泛,多项研究表明不同群体间SNPs 的数目、频率不尽相同,通过比较亚群间等位基因的频率将有助于阐明群体的结构和进化。

 

传统的SNP检测方法耗时长且通量低,基于第二代高通量测序技术的全基因组重测序的方法能够全面、快速、高效地检测出群体的SNP信息,包括低频变异信息。相比传统的方法例如基因芯片而言,基于高通量测序的方法不会造成遗传度的缺失更有利于研究群体的结构和进化历程。

 

项目流程(参照如下)

信息分析(参照如下)

交付结果
数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析
报告:详细的统计图表和方法描述

 

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