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16S/18S rDNA测序

16S/18S rDNA测序


16s/18s rDNA sequencing
通过检测16S rDNA的序列变异和丰度,可以快速了解环境样品中细菌群落多样性信息。通过对真菌进行18S rDNA测序可以快速高效的对真菌进行鉴定分析。
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最后更新:2015-8-4半年访问:56
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16S/18S rDNA测序
16S  rDNA是细菌分类学研究中最常用的“分子钟”,其序列包含9个可变区和10个保守区。其中,可变区因细菌种类而异,且其变异程度与细菌的系统发育密切相关。通过检测16S  rDNA的序列变异和丰度,可以快速了解环境样品中细菌群落多样性信息。目前该方法已经广泛应用在微生物分类鉴定、微生态研究等方面。

相比之下,真菌可以采用18S rDNA测序的方法进行菌种鉴定。18S rDNA是真核生物核糖体小亚基对应的DNA片段,该序列中含有的保守序列可以反映生物物种之间的亲缘关系,而可变区域则可以反映真菌物种之间的差异。通过对真菌进行18S rDNA测序可以快速高效的对真菌进行鉴定分析。

 

项目流程(参照如下)

 

信息分析(参照如下)

 

交付结果
数据:按照Fastq等国际公认的数据格式进行存储,被大多数软件支持,方便后续分析
报告:详细的统计图表和方法描述

 

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