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对于检测较少几种miRNA的表达差异通常采用Real-Time PCR的来对miRNA进行检测,其具有快速、特异性强、灵敏度高等优点。
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简介
MicroRNAs(miRNAs)是一种小的内源性非编码RNA分子,大约由21-25个核苷酸组成。这些小的miRNA通常靶向一个或者多个mRNA,通过翻译水平的抑制或直接降解靶标mRNAs而调节基因的表达。
miRNAs起源于内源性表达转录本,广泛存在于线虫、果蝇、植物、哺乳动物等众多生物体中。
miRNA途径开始于一个miRNA基因的pri-miRNA(PrimarymiRNA)转录本;这个70-100nt的发卡RNAs(pri-miRNA)在核内被核糖核酸酶Drosha加工处理而最终成为pre-miRNA(Precursor miRNA);之后pre-miRNA被核输出蛋白exportin 5转运入胞质,接着被第二个核糖核酸酶Dicer消化为21-25nt的miRNA;这个阶段的miRNA可以结合RISC(RNA-Induced Silencing Complex)并与靶标mRNA互补并列;miRNA和靶序列的互补程度决定了靶基因mRNA在翻译水平被部分抑制或被直接降解。
植物体中,促进靶mRNA降解是主要的工作方式,而哺乳动物中则以翻译水平的抑制为主要方式。
microRNA的表达检测
由于miRNAs在众多程序的调控,诸如发育、细胞增殖和凋亡以及肿瘤发生相关等领域发挥作用,因此miRNAs的鉴定和定量研究成为迅速发展的研究领域。miRNA的发现可以通过克隆特定组织、细胞或者某个生物体特定发育阶段的miRNA并测序完成。microRNA芯片或qPCR的检测方法比较简单,可以快速的对定量已知的miRNA表达差异。
1、microRNA 芯片服务
Agilent Technologies Inc.开发出具有独特设计的miRNA检测芯片,能特异性地检测出成熟的miRNA并能很好地区分高度同源的miRNA 分子。该平台还具有特异性高、灵敏度高等特点。可以广泛地应用于检测和比较各类样品的miRNA表达状态,并通过分析其调控的靶基因来深入分析其调控机制或生物学功能。
作为miRNA芯片的后起之秀,Agilent miRNA芯片自上市之初就受到业界广泛关注,上市两年来,其优异的性能指标更是获得科研工作者的广泛认可,2009年稳占国内市场应用第一名。

Agilent microRNA芯片技术特点:
1. 唯一能通过特殊的探针设计区分成熟miRNA和miRNA前体的芯片平台;
2. 无需分离miRNA,直接用Total RNA 进行实验,只需100ng的Total RNA 即可用来进行标记实验,避免了分离、富集、放大等过程带来的影响;
3. 样品适用范围广:组织、血清、血浆、FFPE、冰冻切片组织、脱落细胞等均可进行实验;
4. 高特异性:特殊的专利探针设计能区别一个碱基的差异;
5. 高灵敏度:检测丰度跨4个log,最高可达6个log,只要存在6000个拷贝的分子就可以检出。
2、qPCR检测microRNA的表达
对于检测较少几种miRNA的表达差异通常采用Real-Time PCR的来对miRNA进行检测,其具有快速、特异性强、灵敏度高等优点。
工作原理 :
茎凸环结构的逆转录引物能与miRNA 3'端部分结合,在逆转录酶的作用下进行逆转录反应,然后特异的正反向引物和SYBR Green荧光染料共同参与的定量PCR反应体系,实现对逆转录产物进行定量检测。

检测优点: