生物信息学数据分析服务

 1.热点生物信息学分析
 1)小RNA数据分析
 2)转录组数据分析 
 3)微生物基因组分析 
 4)基因数字表达谱DGE分析
 5）外显子组数据分析
 6）全基因组数据分析
2. 基因组学相关分析
   1)序列拼接，基因组组装。
   2)序列比对，同源性搜索、物种同源分析。
   3)多序列全局比对，同源进化树构建及进化分析。
   4)EST的基因组定位，可变剪切形式确定 。
   5)Promoters预测与查找，CpG岛，调控元件预测等。
   6)重复序列注释：SSR, STR, LINE, SINE, Transposons等。
   7)基因预测及基因结构分析：真核，原核，mRNA/cDNA编码区预测。
   8)Non-Coding RNA的预测与注释：
     tRNA预测及二级结构分析
     rRNA预测
     MiRNA预测及结合靶点预测
     soRNA预测及甲基化位点预测
   9)SNP分析。
   10)分子进化相关分析：分歧年代，进化树，进化压力（Ka, Ks）。
   11) EST序列/一般序列分析
     序列基本分析：去除载体，污染，聚类，拼接
     表达谱分析：特异表达基因，共调控基因
     Unigene的功能注释及分类
     基于EST的SNP分析
   12)基因的功能注释及分类
     NCBI非冗余核酸库（NT）
     NCBI非冗余蛋白库（NR）
     SwissProt蛋白数据库
     Kegg Pathway数据库
     COG/KOG蛋白家族数据库
     Interpro&GO蛋白功能位点和结构域（domain）数据库
3. 蛋白质组学相关分析
  1)蛋白质亲/疏水性、等电点、抗原性分析及跨膜蛋白，信号肽等性质分析和相似性分析 
  2)蛋白二级/三级结构预测
4. Microarray/Biochio生物芯片数据分析
  1)对基因芯片的表达谱数据进行预处理与归一化分析
  2)使用多种统计方法筛选具有显著性差异表达的基因
  3)对差异表达基因数据进行多种聚类分析，并给出树状图
  4)结合基因GO分类(gene ontology)、信号转导数据库（KEGG），进行相关路径分析、差异表达基因的功能分类、所属信号通路分类等
5. 引物/探针设计
  1)核酸引物、PCR引物、测序引物及杂交探针的设计与评价
  2)用于细菌种属分类的杂交探针设计
  3)用于SNP检测的探针设计
  4)芯片的olgio设计

上海若谷生物科技有限公司(BIOAIDE)是一家为临床及科研客户提供完整的生命科学前沿技术服务、咨询、规划及相关产品的高科技企业，BIOAIDE能提供涵盖从基因组到动物体的全流程解决方案。我们旨在通过自身的核心竞争力，帮助临床及基础科研人员快速、高效完成实验项目并获得高质的实验数据，特别是在基因功能、肿瘤、遗传病、生物材料及骨生物学等领域。我们的团队成员来自于中科院上海生命科学研究院、上海交通大学、Albert-Ludwigs-UniversitätFreiburg、上海师范大学等高校及科研机构，我们有着丰富的基础及临床科研经验，与国内外多所大学及科研机构有着良好的合作关系，能够为您提供高质、高效的实验及咨询服务。