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ChIP seq是指对染色质免疫共沉淀得到的基因进行高通量测序,最终实现将所研究的蛋白的DNA结合位点精确定位到参考基因组上。
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染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA之间相互作用的重要技术手段。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。
服务内容:
针对性项目方案设计+样品检测、ChIP文库构建、测序+标准/个性化生物信息分析
常用策略:
Hiseq 2000,测序技术SE 1 × 36-50 ,数据量: ≥ 1 G 。( 数据量的选择从理论上来说,决定于目的蛋白在全基因组上结合位点所占的比例。)
ChIP-Seq测序数据主要分析内容: