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染色质免疫共沉淀测序分析(ChIP-Seq分析)
ChIP seq是指对染色质免疫共沉淀得到的基因进行高通量测序,最终实现将所研究的蛋白的DNA结合位点精确定位到参考基因组上。
服务类别:测序/合成总访问:1518
最后更新:2014-5-12半年访问:49
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  • 服务介绍
  • 公司简介

   染色质免疫共沉淀(Chromatin Immunoprecipitation,ChIP)是研究蛋白质与DNA之间相互作用的重要技术手段。将ChIP与第二代测序技术相结合的ChIP-Seq技术,能够高效地在全基因组范围内检测与组蛋白、转录因子等互作的DNA区段。  

服务内容: 
    针对性项目方案设计+样品检测、
ChIP文库构建、测序+标准/个性化生物信息分析

常用策略: 
       Hiseq 2000,测序技术SE 1
 × 36-50 ,数据量: ≥ 1   G 。( 数据量的选择从理论上来说,决定于目的蛋白在全基因组上结合位点所占的比例。)

ChIP-Seq测序数据主要分析内容:

      1.测序数据基础分析与评估;
      2.chip捕获区分析;
      3.chip基因功能分析;
      4.其他定制分析(定制化)。
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