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基因组de novo测序也叫做基因组从头测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。
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高通量测序服务——动植物基因组测序
详细描述：
一. 动植物基因组de novo测序
基因组de novo测序也叫做基因组从头测序，是指不依赖于任何已知基因组序列信息对某个物种的基因组进行测序，然后应用生物信息学手段对测序序列进行拼接和组装，最终获得该物种基因组序列图谱。从基因组水平上对物种的生长、发育、进化、起源等重大问题进行研究，将加深我们对物种的认识，在新基因的发现、物种改良等方面发挥巨大作用。
采用传统的Sanger法测定高等动植物的全基因组需要花费大量的人力和物力资源，这极大限制了全基因组测序的发展。第二代高通量测序技术的成熟和广泛应用，大大降低了基因组测序的成本，缩短了测序时间，让更多实验室可以独立开展动植物基因组测序项目。
生物信息分析
1. 基因组拼装统计
提供基因组拼装的基本信息，包括原始数据统计、测序覆盖率统计、Contig N50大小、Scaffold N50大小、基因组GC含量等信息。
2. 基因组注释
包括基因预测、基因功能注释（同NR、Swiss-prot、Interpro等数据库进行同源比对）、重复序列分析及Non-coding RNA注释等。
3. 基因功能分类
GO分类、KEGG通路分析等。
4. 比较基因组学及进化分析
通过比较相近物种的基因组数据，从基因功能、基因组骨架结构、分子进化等方面对目标基因组进行分析。
5. 建立数据库
建立符合国际标准且具有良好兼容性的基因组数据库，实现基因组数据的查询与共享。
二. 动植物基因组重测序
在已知物种基因组的情况下，对物种内的不同个体或某个个体的不同组织进行基因组重测序，可以在全基因组水平上发现不同个体或组织细胞之间的差异。通过这种方法，可以寻找出大量的单核苷酸多态性位点（SNP），插入缺失位点（InDel，Insertion Deletion），结构变异位点（SV，Structure Variation），拷贝数变异（Copy Number Variation，CNV）等变异信息，从而获得生物群体的遗传特征。这对在群体水平上研究物种的进化历史、环境适应性、自然选择等方面具有重大意义。利用全基因组重测序有助于快速发现与动植物重要性状相关的遗传变异，缩短分子育种的实验周期；有助于发现人类疾病相关的重要变异基因，加快生物医药研发的速度等。可以预期随着测序成本的进一步降低以及已知全基因组序列物种的增加，重测序必将成为生命科学领域的研究利器。
生物信息分析
1. 原始数据统计
2. 短序列mapping至参考基因组
3. 分析mapping区域reads的覆盖度、重复性、覆盖碱基的质量及reads方向
4. SNPs、InDel、CNVs检测
5. 结构变异（SVs）和基因组重排事件分析
美吉优势
1. 拥有标准化操作实验室和高通量测序技术平台，可以根据合作伙伴要求灵活安排实验，实验周期短，质量可靠。
2. 拥有Roche 454和Illumina Solexa两种高通量测序平台，合作伙伴可根据具体需求进行选择，以获取最佳的实验结果。
3. 技术人员经验丰富，可以根据合作伙伴要求在第一时间提供实验方案、解决实验问题、分析实验结果。
4. 拥有专业的生物信息团队和大型计算机，可以为合作伙伴提供个性化的生物信息分析服务。
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