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EST文库分析

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EST文库,文库基因注释,差异表达分析,基因功能注释
与翔科飞提供专业的生物信息学服务,包括生物信息学软件定制、设计及算法整合、具体疑难生物学数据分析、高通量生物学数据分析,以及基于生物信息学分析探路的实验路线设计等。
服务类别:芯片与生物信息学总访问:3071
最后更新:2010-11-8半年访问:60
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服务商: 北京与翔科飞生物信息科技有限公司 查看该公司所有服务 >>
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读取测序峰图(Base calling) 通过分析测序峰图文件,读取DNA碱基序列信息以及各个碱基的测序质量得分。

EST序列质控(Quality control) 屏蔽简单重复序列,载体序列,引物序列,低质量测序部分序列等。

文库基因注释(Gene annotation)将EST文库序列通过合适的blast方法比对到各个标准数据库,从而获取EST到已知基因的对应关系。

基 因集富集分析 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA) 富集分析是基于统计学检验的case/control高通量分析方法,可用于揭示生物学样本(case相对于control)中被显著激活或显著抑制的功 能。与翔自主开发研制了不同的功能分析数据库,可以提供对GO、KEGG、BioCarta、疾病相关基因、肿瘤相关基因、转录因子结合位点等功能的富集 分析。

基因功能注释(Gene function annotation),通过KOG/COG数据库完成EST序列的功能注释

 
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