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泛肿瘤800 gDNA标准品带你了解两大平台检测结果差异
点击次数:1405 发布日期:2020-5-18  来源:菁良基因

2019年,菁良基因重磅推出了泛肿瘤800 gDNA标准品,该产品专为满足检测机构日常质控而研发,涵盖了多种肿瘤类型如肺癌、结直肠癌、乳腺癌、血液病等,一经推出,即受到广大用户的关注和欢迎。

 

作为全球最大肿瘤基因检测标准品,为了满足检测机构多种平台不同方法下标准的统一性,菁良基因对该产品进行了多平台方法比较供用户参考。

 

菁良选择了市面上常用的进口检测Illumina平台X10、和MGISEQ-2000RS测序平台搭配,CoolMPS 高通量测序试剂套装 (MGISEQ-2000RS FCL PE100)进行验证。

 

700X WES

 

Illumina:Illumina 测序平台,X10

MGI: MGISEQ-2000RS,CoolMPS 高通量测序试剂套装 (MGISEQ-2000RS FCL PE100)
 


结果表明,Q30,mapping rate,coverage结果在国内外两大平台的表现基本一致,两次结果下MGI平台的duplication更低。

 

GENE

 

将ddPCR验证过的其中13个位点单独列出来分析,在相同测序深度情况下,两个平台检测准确率差别不大,甚至MGI平台搭配CoolMPS测序试剂能检测出的突变位点更多。
 

 

 

菁良基因泛肿瘤800

 


产品特点

☆样本来源于人类细胞系

☆覆盖多种癌症有关变异位点

☆验证位点多(大于320个基因、720个突变)

☆变异类型全

☆变异位点多为已知数据库位点

☆突变位点频率范围宽(1-100%)

☆ddPCR验证位点突变频率呈梯度(1-7%)

☆变异位点分布范围广

☆多种平台验证变异位点

☆全外显子测序采用业内公认度极高的捕获芯片及测序平台

☆涵盖位点包含多个国际知名肿瘤检测Panel

 

GeneWell
 


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