Rag1敲除小鼠助力揭示肠道真菌-细菌氨基酸"博弈"调控结肠炎进展

炎症性肠病（IBD）是一类慢性、反复发作的肠道炎症性疾病，全球患者负担沉重。肠道菌群是影响 IBD 的关键环境因素，但既往研究多聚焦细菌或单一真菌，对不同界别微生物之间的相互作用如何影响疾病进展，认识仍然有限。白色念珠菌（Candida albicans）是肠道中研究最广的条件致病真菌，其过度生长在 IBD、肿瘤等多种疾病中被反复观察到，然而究竟是哪些微生物在"约束"或"纵容"它的定植，长期缺乏清晰答案。
 

2026年5月28日，上海交通大学医学院附属仁济医院洪洁、陈豪燕团队，联合海军军医大学盛春泉团队、上海交通大学医学院刘宁宁团队与上海儿童医学中心沈楠团队，在 Cell Host & Microbe 在线发表题为"Cross-kingdom metabolic interactions govern Candida albicans overgrowth and colitis progression"的研究论文，揭示了肠道真菌极细枝孢菌、白色念珠菌与细菌脆弱拟杆菌之间围绕氨基酸代谢展开的三方互作网络。

南模生物为该研究提供了Rag1基因敲除小鼠​（目录号：NM-KI-00069）。
研究首先基于156例受试者组成的仁济队列，结合粪便测序与多组学分析，鉴定出肠道真菌极细枝孢菌（Cladosporium tenuissimum）在健康人群中富集，并具有缓解结肠炎的活性。进一步实验表明，极细枝孢菌通过竞争性消耗氨基酸鸟氨酸，抑制白色念珠菌的过度生长，从而减轻后者驱动的结肠炎加重；当敲除极细枝孢菌利用鸟氨酸的关键酶后，这一抑制作用随之消失。

随后，研究团队发现了一个转折：白色念珠菌并非被动受制，它能够转而利用另一种氨基酸苏氨酸，实现"营养逃逸"，重新获得生长优势并加剧肠道炎症。值得注意的是，产苏氨酸的脆弱拟杆菌（Bacteroides fragilis）能够为白色念珠菌的逃逸"提供原料"，形成一条细菌-真菌代谢轴，进一步加重结肠炎。与此相对，在饮食中限制苏氨酸摄入，则能显著抑制白色念珠菌的过度生长，并减轻其驱动的结肠炎。

综上所述，此研究将视野从"单一病原微生物致病"拓展到"跨界微生物代谢网络调控疾病"，揭示了肠道细菌、真菌与营养因子之间精细的氨基酸博弈，为 IBD 提供了从微生物代谢互作入手的新概念与干预思路。