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ComplexHeatmap包绘制密度热图的参数调整和添加注释方法

浏览次数:1602 发布日期:2025-6-12  来源:本站 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负
在展示多样本数据分布时,除了箱型图和小提琴图,密度热图也是一个不错的选择。下面我们就来了解一下ComplexHeatmap包绘制出的密度热图。
 
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01 密度热图介绍 

密度热图中每列为一个样本,颜色体现密度,越接近深红色密度越高,深蓝色为密度低。五条黑色虚线分别对应了五个分位,红色虚线为均值。

02 参数调整 

修改y轴范围 

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修改色阶 

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样本聚类 

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添加列注释 

下图在上方添加了颜色条,用于区分样本分组,下方添加了散点图注释。

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03 添加为热图列注释 

密度热图不仅可以添加列注释,也可以作为列注释添加在常规热图的上方或下方。下图添加了两个列注释,第一个是密度热图,用于展示样本表达值的分布情况;第二个是柱状图,用于展示每个样本中某指标的高低。

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发布者:上海生物芯片有限公司
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