自动化有一系列好处,包括提高可重复性和减少实验室工作人员的接触

随着世界各地的实验室应对筛选大量 SARS-CoV-2 样本的挑战,这些实验室的管理人员已转向使用自动化来解决一些关键问题。
无论这些实验室的规模是国家级别的,每天处理数十万个样本,还是在组织层面的小规模和敏捷实验室测试,在这些工作流程中都有适应自动化的一席之地。在流程中实现自动化带来了一些显著的优势。通过减少手动操作步骤的次数,可提高可重复性。由于手工进行的步骤较少,这也减少了实验室工作人员的潜在接触。
挑战: 许多实验室同时启动 COVID-19 筛查计划的需求导致移液器吸头和试剂等资源稀缺。实验室自动化为测试和筛选过程带来了显着的好处,但由于高通量仪器使用了大量的这些耗材,这一问题会进一步恶化。
解决方法: 使用小型、灵活的液体处理解决方案,不依赖一次性吸头,并且可以几乎消除因死体积过大而造成的试剂浪费,使实验室管理人员能够从自动化的优势中获益,并减少对稀缺资源的依赖。
FORMULATRIX®的MANTIS®和TEMPEST®液体处理器背后的技术是独一无二的,使用的是基于正位移微隔膜的芯片。这意味着试剂可以直接分配到用于样品制备和 qPCR 分析的 96 或 384 孔板和深孔模块中,而无需一次性塑料移液器吸头。由于这些液体处理器的最小分配体积分别仅为100 nL 和 200 nL,这也为通过小型化减少总反应体积开辟了道路,从而省下了宝贵的试剂。
在下面的示例中,我们重点介绍了三个不同实验室使用MANTIS 液体处理器的经验。
牛津大学 Weatherall 分子医学研究所、根特生物技术公司 Biogazelle 和利物浦大学蛋白质组研究中心。
Neil Ashley博士,Wimthell分子医学研究所(WMM)在英国牛津的单细胞核心设施管理者提出了SARS COV-2 qPCR工作流程,在夏季时这一流程已经在其设施上操作了。
在Neil 的网络研讨会中,他讨论了使用MANTIS作为工作流程的一部分,强调了所用移液器吸头数量的减少以及其整体反应规模的成功小型化。通过将MANTIS 液体处理器集成到用于 COVID-19 测试的现有 RT-qPCR 工作流程中,一致且可靠的非接触式分配提高了吞吐量并消除了对制造商专有吸头的依赖,这意味着全球供应短缺不再是阻止RT-qPCR检测以所需容量运行的障碍。
MANTIS 液体处理器在减少化验量、显著节省成本以及帮助避免试剂短缺时的延误等方面发挥了关键作用。
Jo Vandesompele教授是根特大学医学与健康科学学院功能基因组学和应用生物信息学的研究教授,也是Biogazole公司的联合创始人环境中提供RNA和DNA生物标记物服务。
2020年4月,Biogazole推出了一个高通量、模块化和可扩展的SARS-CoV-2 RT qPCR测试平台,每天处理多达6000个患者样本。诊断测试是在ISO17025质量管理体系下进行的,该体系要求新仪器根据具有严格验收标准的预定义计划进行验证。

Biogazelle 选择 MANTIS 作为其诊断 SARS-CoV-2 RT-qPCR 测试中的自动液体处理器,因为它占地面积小、灵活且高速准确分配。除了仪器的技术能力外,易于使用的软件可确保在筛选过程中以最低的培训要求快速部署。完整的应用说明和网络研讨会详细介绍了 Biogazelle 团队为将 MANTIS 纳入其 ISO 17025 认可实验室而开展的工作,可以在 FORMULATRIX 网站上找到关于这个的相关信息。
Ed Emmott 教授是利物浦大学蛋白质组研究中心 Emmott 实验室的负责人。该实验室的目标是使用和开发蛋白质组学方法来研究 RNA 病毒复制和病毒-宿主相互作用,特别是使用单细胞蛋白质组学来帮助这项研究。随着对有效SARS-CoV-2疫苗的争夺 持续吸引公众和制药行业的关注,认识到在进一步了解病毒与宿主相互作用方面的并行研究工作是很重要的,因为这可能会发现新的治疗靶点。
Emmott 实验室正在使用单细胞蛋白质组学,遵循SCoPE2 协议,对 COVID-19 病毒进行基础研究。与之前的单细胞蛋白质组学技术相比,由于试剂使用的显著小型化和用量减少,以及更短的实际操作时间,加上样品制备和测量的吞吐量显著加,SCoPE2的成本因而降低了。在最近的一份应用说明中,Ed 讨论了 MANTIS 液体处理器如何对这一成功起到关键作用:
MANTIS 提供了亚微升体积的可靠分配,即便是分配非常困难的液体类别,如用于存储串联质量标签(TMT)的100%乙腈。
通过将MANTIS和TEMPEST液体处理器纳入其COVID-19 测试工作流程,世界各地的许多实验室已经认识到这些显着优势。