快速基因条码NextGenPCR和MinION在生态样本进行物种级分类的应用

浏览次数：1047　发布日期：2023-9-1　来源：本站　仅供参考，谢绝转载，否则责任自负

DNA 条码可用于标本样本的物种级分类，但很少用于需要在数小时内估计物种丰富度或鉴定害虫或入侵物种的时间比較緊的项目。主要原因是现有的快速条形码工作流程要么过于昂贵，要么只能由训练有素的员工在装备精良的实验室中执行。

德国莱布尼茨进化与生物多样性科学研究所的综合生物多样性发现中心研發了一個简单的工作流程。他們採用HotSHOT對樣本進行快速 DNA 提取、並利用MBS公司的NextGen PCR® 系統进行快速基因條碼及扩增基因片段，以及使用低成本 MinION 测序仪进行测序進行樣本測序。最後，他們在 6 小时内为 285 个标本生成和识别 250 个基因条码来展示该方法的强大功能和高效性。他們们认为使用简化的基因条码工作流程使現在的物种级分类可以更快，更准确，并且具有足够的成本效益。它应该在许多项目中取代形态物种分类。