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全球领先的基于CRISPR诊断技术的整体解决方案

浏览次数:321 发布日期:2023-4-19  来源:本站 仅供参考,谢绝转载,否则责任自负

ToloBio首次发现 CRISPR-Cas12蛋白具备高效的“反式切割活性”,并基于该酶的独特优势研发了“福尔摩斯/HOLMES”核酸快速检测平台技术(one-Hour Low-cost Multipurpose highly Efficient System)。相比于传统的分子诊断技术,基于CRISPR的HOLMES技术具备高灵敏、高特异、快速便捷等优势,被《Science》杂志誉为“下一代分子诊断技术”,在病原菌检测、遗传疾病筛查、精准医疗等众多领域有很大的应用潜力。

 

Cas12a

HOLMES检测平台[1]

 

  • Cas12a家族是一类由单个crRNA介导的核酸内切酶
  • 在HOLMES核酸检测系统中,Cas12a: crRNA: 靶标DNA分子三元复合物的形成会激活Cas12a的反式剪切活性,可无差别的剪切反应体系中的ssDNA分子,包括荧光标记的ssDNA探针,从而产生大量的荧光信号,指示检测结果为阳性

Cas12b

HOLMESv2检测平台[2]: 率先实现“一管法”和“绝对定量”

 

  • 采用嗜热菌来源的Cas12b,比Cas12a更加耐热,使核酸扩增与靶标检测在同一管中进行
  • Cas12b: crRNA: 靶标DNA三元复合物会激活Cas12b的反式剪切活性, 可无差别剪切反应中的ssDNA分子,包括荧光标记的ssDNA探针,从而产生大量的荧光信号,指示检测结果为阳性
  • “一管法”体系既能保持对SNP和甲基化位点的分辨能力,又有效地避免气溶胶污染的风险,同时缩短检测耗时
  • 通过结合HOLMESv2与digital PCR体系,可实现对靶标核酸的绝对定量

Cas13a

ToloBio拥有Cas12核酸检测的方法学专利,并在2020年与美国科学院院士张锋教授领衔创立的Sherlock Biosciences就Cas12和Cas13诊断技术达成了中美市场的“专利交叉授权”合作。2022年11月,双方又进一步签署了全球范围内的CRISPR诊断“专利交叉授权”合作协议,完成了ToloBio在CRISPR检测领域方法学专利的全面布局。

HOLMES与SHERLOCK“双剑合璧”[3]

 

  • Cas13家族是一类由crRNA单独介导的核酸内切酶,可特异地识别并剪切靶标ssRNA
  • Cas13与crRNA、靶标RNA形成三元复合物后,激活针对非特异序列ssRNA的“反式剪切活性”,将体系中的ssRNA切碎
  • 靶标RNA浓度越高,体系反式剪切ssRNA报告探针的速度更快,释放荧光信号到达平台期的时间越短

Cas12f

 

不同靶ssDNA存在时,Cas12f1行使高效反式剪切活性的荧光信号结果

 

  • Cas12f核酸酶是依赖sgRNA介导的内切核酸酶,倾向于特异结合并剪切靶标ssDNA,且无需PAM位点
  • Cas12f蛋白分子量普遍较小(约61.5kD),这是其主要优势之一
  • 与Cas12a/b功能类似,已有文献报道,Cas12f对ssDNA靶标中SNP位点的分辨能力高于Cas12[4]。

CRISPR-Dx的优势

  • 多重:联检/降本;微流控/盘式芯片;色码CARMEN;体系多重
  • 绝对定量:液相微球/固态微孔
  • 超灵敏/特异:1-2个拷贝可测;识别PCR灰区、SNP位点、甲基化位点
  • 超快速:1-5min内完成剪切;恒温扩增;One-Step;免扩增;免提取核酸
  • POCT/全自动:LFA;LDT;全流程自动化;便捷/成本低

 

Reference:

[1] Li S, Cheng Q, Wang J, et al. CRISPR-Cas12a-assisted nucleic acid detection[J]. Cell Discovery. 2018, 4: 20.

[2] Li L, Li S, Wu N, et al. HOLMESv2: A CRISPR-Cas12b-Assisted Platform for Nucleic Acid Detection and DNA Methylation Quantitation[J]. ACS Synthetic Biology. 2019, 8(10): 2228-2237.

[3] Gootenberg JS, Abudayyeh OO, Lee JW, et al. Nucleic acid detection with CRISPR-Cas13a/C2c2. Science. 2017;356(6336):438-442.

[4] Harrington LB, Burstein D, Chen JS, et al. Programmed DNA destruction by miniature CRISPR-Cas14 enzymes. Science. 2018;362(6416):839-842.

发布者:上海优宁维生物科技股份有限公司
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