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illumina测序新品NextSeq1000与NextSeq2000性能的预测

浏览次数:5158 发布日期:2020-1-16  来源:微信公众号:基因Share

大家好,正床上躺着看《庆余年》的我收到了宇哥发来的微信,才想起来今天竟到了illumina新品发布会的日子,看着手机上的产品宣传图片我不由的想起来家里的加湿器,还是自带小夜灯和触控屏幕的空气加湿器(只不过这加湿器有点贵啊,21万美刀)。
 

图片来源于illumina中国官网

 

接下来我们来简单介绍一下illumina的新产品—NextSeq1000与NextSeq2000,我粗略的看了下illumina官网上新产品的宣传彩页,顿感些许失落,但是谁知后面会不会也难逃真香”定律呢?

前几天我写了一篇《2020 illumina新品发布预测》的文章,带着“必然蒙对”的傲娇对号入座的瞄了一下我当时的预测,嗯!就是这个。

在我当时的新品预测中,其中一个预测是illumina可能会发布一款介于NextSeq系列和Novaseq6000之间的机型,以补充两机型之间的“产品断崖”,该机器的数据产量可以相当于Novaseq的SP芯片(800M Reads,PE150,240Gb/Flowcell),而测序试剂的价格将介于NextSeq High-Output芯片($40/Gb)和Novaseq SP芯片($18/Gb)之间。我当时预测的这款机器的主要目标客户群体是以北美地区的Hiseq系列或者Nextseq系列使用者为主,之所以如此判断,原因有二:

 

第一,是我预测illumina2019年在中国市场几乎是零增长,业绩将基本与2018年持平(2018年illumina大中华区营收为3.65亿美金,占总营收的11%),造成这份态势,华大智造MGISEQ-2000测序系统优秀的市场表现“功不可没”,如果illumina发布介于NextSeq和Novaseq之间的机型,那么该机器的主要性能参数将与华大智造的MGISEQ-2000接近,所以我不认为illumina推出这类机型会对中国市场的客户有太大的吸引力,自然中国市场(甚至是亚太市场)也不会是其主要目标客户群体(起码短时间内不是) 

 

第二,北美才是illumina的大本营(第一大市场,2018年illumina美国市场营收为17.73亿美元,占总营收的53%),所以这次韭菜还是要回家割,业绩增长的压力还是要靠家里人来一起“扛”的。北美地区还有大量的Hiseq2500和Hiseq4000等老旧机型在服役,这些机型开机成本较高、运行速度较慢、通量较大,而Nextseq系列的单位数据成本又太高、数据产量上也无法满足后续单细胞测序、基于液体活检的Pan-Cancer等应用的检测需求,所以一款“中间机型”的需求应运而生。但这让我想到了美国的智能手机市场,用户的选择真是少到可怜啊,不是苹果就是三星,最多加个LG,哪有我们幸福... ...另外美国这么多CLIA实验室,这RUO版本的机型也是可以拿过来直接用的。

另外,刚看到Genomeweb的推文,Roche与illumina将基于NextSeq550Dx测序平台合作开发体外诊断试剂盒,而且illumina宣布即将推出NovaseqDx,所以如我预测,NovaseqDx即将来临,后续将联合DRAGEN Bio-IT在Pan-Cancer(ctDNA)、cWES和cWGS应用中担当重任。

 

好的,上面啰嗦这么多,总结成一句就是想说明咱这预测不是胡扯,那么接下来咱们简单看一下本次发布的新品具体的参数。

首先我们来看一下尺寸大小

NextSeq550的长宽高为 63.5cm×53.3cm×58.4cm,毛重为151.5kg。

Nextseq2000的长宽高为65cm×60cm×60cm,重量为141kg。

从体型上来看,这个小夜灯加湿器与Nextseq550是基本一样的。

     

接下来我们再来看一下四款仪器的性能参数对比表

 

 最后我们还说一下NextSeq1000/2000有哪些创新的地方?

 但因为目前产品细节公开的还是太少(宣传75项创新啊),并且下面的内容,宣传彩页上都是现成的,所以我还是长话短说为大家做简单归纳:

 

 

第一,NextSeq1000/2000测序系统直接搭载了DRAGEN Bio-IT FPGA Secondary analysis,简单来说就是分析加速系统。可以用来大大加快变异检测的分析速度。

第二,简化的上机操作流程,将废液桶和测序试剂卡槽集成在一起,待loading的文库也加入试剂卡槽,测序芯片插入试剂卡槽,再将测序试剂盒插入测序仪,搞定!

第三,可以在云端对本次测序的运行模式进行设定(例如读长、Barcode等测序参数)。
 


 

这样看下来这机器有点AIOT的意思啦,好了,今天就到这里,后续获得更多新品细节后再与大家交流学习。


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标签: illumina 测序
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