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提供DNA甲基化芯片分析和单个基因的甲基化位点分析。
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| 服务商： 上海博仕生物医学服务中心 | 查看该公司所有服务 >> |
DNA甲基化分析：
DNA的甲基化修饰是基因表达调控的一种重要手段，基因组DNA甲基化分布的有序建立和维持对保证个体正常发育至关重要，相反，如果这套甲基化调控机制出现问题，细胞功能将发生异常，可能导致细胞癌变，因此基因甲基化研究是肿瘤机制研究中的一大热点。
DNA的甲基化主要发生在CpG岛（对于GC%含量>57%，片段长度>250bp的DNA片段定义为CpG岛），其甲基化状态的确定主要是通过甲基化测序来实现：样本经亚硫氢酸盐处理后，甲基化的胞嘧啶（C）保持不变，但非甲基化的胞嘧啶被转化成脲嘧啶，因此在利用该处理产物作为模板的PCR产物中，甲基化的胞嘧啶还是胞嘧啶，但非甲基化胞嘧啶变成了脲嘧啶（胸腺嘧啶），通过测序对比很容易看出目的片断中哪些胞嘧啶是甲基化的，哪些没有，而且还可以用定量PCR的方法对甲基化的比例作初步分析。
DNA的甲基化主要发生在CpG岛（对于GC%含量>57%，片段长度>250bp的DNA片段定义为CpG岛），其甲基化状态的确定主要是通过甲基化测序来实现：样本经亚硫氢酸盐处理后，甲基化的胞嘧啶（C）保持不变，但非甲基化的胞嘧啶被转化成脲嘧啶，因此在利用该处理产物作为模板的PCR产物中，甲基化的胞嘧啶还是胞嘧啶，但非甲基化胞嘧啶变成了脲嘧啶（胸腺嘧啶），通过测序对比很容易看出目的片断中哪些胞嘧啶是甲基化的，哪些没有，而且还可以用定量PCR的方法对甲基化的比例作初步分析。
单个基因的DNA甲基化分析
服务内容描述；提供单基因已知位点的甲基化分析，通过对亚硫氢酸盐处理前和处理后的样品的测序或定量PCR分析获得DNA甲基化的位点信息。
客户方提供：组织细胞样品或抽提好的基因组DNA。
服务方提供：PCR电泳图谱、测序和定量原始数据等。
质控验收标准：测序图谱或定量原始数据等。
甲基化芯片分析：
针对所有的CpG岛设计探针序列制作成芯片，如Nimblegen的人的甲基化芯片，设计CpG岛46957个，比通常认为的人类全基因组约28000个CpG岛还多了60%，是为了覆盖人类全基因组所有的CpG岛及把有可能做为调控元件的富含CG位点的片段都包含进来，并通过甲基化片段特异性结合蛋白或抗体将甲基化位点片段富集起来，通过芯片杂交就能获得全面的甲基化信息。
应用：
l 全基因组范围内检测甲基化位点。
l 研究启动子甲基化对基因的调控
l 比较不同细胞、组织、肿瘤的甲基化图谱
服务内容描述；通过对照样品和目标样品的对照杂交分析获得基因组水平的DNA甲基化的表观遗传数据。可选用的芯片有Agilent和Roche的Nimblegen甲基化芯片，并提供后期的单个基因的验证实验。
客户方提供：组织细胞样品或抽提好的基因组DNA。
服务方提供：样品质控数据，芯片杂交数据库附光盘。
质控验收标准：样品质控数据、芯片内部质控数据。
手机版：DNA甲基化分析
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