外显子研究

真核生物的基因组中存在外显子和内含子现象，因此一些基因由于差异性剪接，可以形成几个长度不同的转录本，这些转录本在功能上可能会有一定的差异。随着研究的深入，研究者不仅需要知道一个基因所有转录本的表达情况，还需要知道每一个外显子的表达情况。以前，在设计基因表达谱芯片时，探针选取的基本上是靠近mRNA 3’端的序列，无法检测差异性剪接的情况，而Exon Array在选取探针序列时，每一个外显子都设计了3-4个探针，并且在实验过程中尽量保证转录本在5’端的完整性，这样可以获取一个基因不同外显子的表达情况。

可检测的外显子数约一百万个，代表了约30万个不同转录本（差异性剪接算多种），其中9万个转录本超过一个外显
子．
探针长度为25mer，平均PSR（probe selection region）127bp。

应用：
•发现被跨越的外显子
•发现保留的内含子
•寻找互相排斥的外显子使用
•寻找不同的启动子区域
•寻找不同的PolyA位点
•寻找不同的剪接供体和受体位点

上海沪晶生物科技有限公司座落于浦东张江高科技园区内，是上海生物芯片公司旗下的销售公司。
上海生物芯片公司是由上海创业投资有限公司、中科院上海生命科学研究院、中科院上海微系统与信息技术研究院、复旦大学、交通大学、上海第二医科大学附属瑞金医院、上海第二军医大学附属东方肝胆医院、国家人类基因组南方研究中心、上海博星基因芯片有限公司、上海华冠生物芯片有限公司和上海复旦张江生物医药股份有限公司等十一家发起单位共同出资组建而成。2003年2 月，公司被国家计委批准建设“生物芯片上海国家工程研究中心”。