微卫星(STR)分析服务

一:定义

    微卫星（microsatellite analysis）即短串联重复(Short tandem repeat，STR)，它是由2-6bp重复单位构成的DNA序列，通常多态性片段长度在100-300bp。

二:原理及应用

    以少数几个核苷酸 ( 多数为 2-4 个 ) 为单位多次串连重复的 DNA 序列。也称为简单序列重复 (simple sequence repeats,SSR) 、短串连重复 (short tandom repeats) 或简单序列长度多态性 (simple sequence length polymorphism) 。微卫星标记是随 PCR 技术而广泛应用起来的 , 由于其序列简短 , 通过 PCR 很容易从基因组 DNA 中特异性地扩增出来 , 大大简化了微卫星多态性分析的操作。研究者只需在目标基因座设计一对或多对引物 , 通过 PCR 反应从模板 DNA 中将该基因扩增出来 , 然后使用测序仪进行电泳分离分析 即可 。微卫星分子标记的另一优点是在基因组中分布广泛 , 而且多态性丰富。研究表明 , 在真核生物中大约每隔 10~50kb 就存在一个微卫星 , 哺乳动物基因组中约有 (5~10) × 10 4 个这种微卫星 而且呈等显性遗传 , 可以从电泳结果中直接区分纯合体和杂合体基因型。因此 , 这种分子标记已被广泛应用于构建基因图谱、种质鉴定、亲缘关系分析、分子标记与经济性状关系分析及遗传疾病诊断。

三：服务内容

    多态性标志STRs，由于其种类多和分布广等特点，已广泛应用于遗传多样性分析、连锁图谱制作、疾病连锁分析和家系标识等研究。  作为主要的STRs分析手段，GeneScan是一种用途广泛的DNA片断分析技术，与传统方法相比，GeneScan具有快捷、精确度高和通量大的优点。美季通过ABI3730型测序仪为国内外客户提供高品质的基于GeneScan技术的STRs分析相关服务。

全基因组扫描
        我们使用ABI全基因组扫描试剂盒提供全基因组扫描服务，该项技术选用ABI-Perlin-Elmer公司提供的382个微卫星标记，覆盖了人类基因组（22条常染色体，2条性染色体）的所有区域。

特定区域位点的扫描　
       针对某一染色体的可疑区域，选取部分微卫星位点进行扫描服务，具体项目包括实验方案设计、根据方案进行PCR、ABI 3730型测序仪数据采集、利用专业软件进行数据分析和最终的连锁分析等。

• 实验方案的设计, 包括荧光标记的选择，引物的设计、合成和标记，内标 的选用 等等；
• 完成荧光 PCR ，并在测序仪上完成电泳扫描 , 数据采集。
• 用 GeneScan4.0 软件对收集到的数据进行处理分析 , 提供产物片段大小、数量多少的信息数据。

五：收费标准

• 全基因组扫描：询价
• 定区域位点的扫描

普通引物：1.5元/碱基

引物费用 :我们推荐的荧光标记有 6FAM 、 HEX 、 NED 等，合成费用为300元/条；您也可以自己合成。

PCR费用:20元/样本，包括预实验和检测。

分型费用 :如果您已经完成 PCR 扩增只需要进行电泳分型、数据处理，包含内标价格为 10元 / 样本。不包含内标价格为 8元 / 样本，不足 48 个的按照 48 个收费。