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SNP分型业务
SNP分型服务应用连接酶特异检测反应(LDR)技术,即当两条寡核苷酸与互补靶DNA完全配对时,连接反应才能顺利进行,否则连接反应不能进行的原理,实现对SNP 位点的检测。
服务类别:测序/合成总访问:2442
最后更新:2009-12-29半年访问:61
参考报价:询价025-83607783/83607782
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  • 服务介绍
  • 公司简介

目前主要应用领域
◆复杂疾病的易感性基因分析与基因定位
◆环境因子易感基因的检出与病原体基因分析
◆药物开发与个体用药
◆个体识别与法医鉴定
◆系统发育分析与病理分子遗传机理的阐明
◆生物进化与遗传分析


主要服务方案
SNP分型服务主要利用连接酶特异检测技术,对需检测SNP位点设计特异性探针,在连接酶的作用下,当特异性的寡核苷酸探针与互补靶序列DNA完全配对时连接反应顺利进行,若寡核苷酸探针与其不完全配对,则连接反应不能进行。最后通过测序仪检测,得到分型结果。



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核心技术:

◆多重PCR
◆多重LDR
◆Megabace 电泳检测
原理示意图:




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服务流程
分型样品的要求:

1、若分型样品为基因组DNA或质粒DNA ,样品要求:DNA浓度≥5ng/ul,体积≥10ul,纯度 OD 260/280 在1.7~1.9之间。如果客户要求提供样品纯化服务,我们对每个样品将收取10元纯化费。
2、若分型样品为基因组DNA,样品要求:DNA浓度≥5ng/ul,体积≥10ul,纯度 OD 260/280 在1.7~1.9之间。如果客户要求提供样品纯化服务,我们将对每个样品收取10元纯化费。
3、客户每次在运送样品的时候,应在送样包裹中放置足量的冰袋,以减少的运输过程中因温度变化导致样品变质的可能。请在每次寄出样品后及时与本公司分型部联系,可以E-mail或者传真的方式告知样品的详细信息,以便我们在收到样品后能及时与您进行沟通确认。
4、我们将自收到客户样品之日起2个工作日内,对客户样品进行核查,如样品在接受过程中发现异常情况,或若经过质检,发现样品不符合我们的检测要求,都将及时与客户联系,由客户重新提供合格样品。
5、我们在提供单核苷酸多态性(SNP)分型服务的过程中,会妥善保管您提供的所有样本和样本信息,以免丢失、缺少、变质或污染,当实验结束后,我们会将所有剩余样本全部送还给您,或按照您的要求妥善处理。
6、我们与客户签订服务协议后,自样品移交之日起,我们承诺将对客户的样品承担妥善保管和因实验需要而合理使用的义务,对于实验过程中的样品损耗(包括实验失败造成的样品损耗)以及由此可能带来的相关问题(如实验终止、实验方案调整、重新准备样品等),我们不承担任何赔偿责任。

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客户将得到的数据
不断发展,不断完善
1.SNPs结果(ExceL表格);
2.实验过程中涉及的电泳图,测序峰型图(见下样图);
3.扩增和反应体系所涉及的引物序列;
4.客户所需的其它资料。



为满足客户大批量样品检测的要求,公司正在引进高通量SNPlex技术,SNPlexGenotyping System 是基于荧光检测方法来进行的,其检测原理:DNA模板直接与一套3个探针组成的系统结合,这3个探针包括2个等位基因特异性探针(ASO探针)和一个位点特异性探针(LSO探针);当ASO探针和LSO探针与模板完全匹配时,连接酶连接两条探针。然后,使用生物素标记的PCR引物扩增该连接产物。生物素标记的扩增产物结合在链霉亲和素包被的杂交板孔中,通过碱变性的方法使生物素标记的单链PCR产物保留在杂交板中,然后该单链PCR产物的特殊部位与一套通用Zipchute探针杂交结合。这些探针带有荧光标记,它们具有特殊的片段与单链PCR产物的特殊部位互补,还包括有修饰部分,一条Zipchute探针对应一个待检测等位基因。然后将杂交捕获到的Zipchute探针分离出来,通过毛细管电泳进行检测,最后通过GeneMapper软件分析来确定SNP的基因型。

此方法具有检测通量高、分型快、实验设计灵活、在实验应用中可升级空间大等优点。

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